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Enregistrement W4311140049 · doi:10.1016/j.isci.2022.105783

Molecular basis for antiviral activity of two pediatric neutralizing antibodies targeting SARS-CoV-2 Spike RBD

2022· article· en· W4311140049 sur OpenAlexafffund
Yaozong Chen, Jérémie Prévost, Irfan Ullah, Hugo Grisales Romero, Véronique Lisi, William D. Tolbert, Jonathan R. Grover, Shilei Ding, Shang Yu Gong, Guillaume Beaudoin-Bussières, Romain Gasser, Mehdi Benlarbi, Dani Vézina, Sai Priya Anand, Debashree Chatterjee, Guillaume Goyette, Michael W. Grunst, Ziwei Yang, Yuxia Bo, Fei Zhou, Kathie Béland, Xiaoyun Bai, Allison Zeher, Rick Huang, Dung N. Nguyen, Rebekah Sherburn, Di Wu, Grzegorz Piszczek, Bastien Paré, Doreen Matthies, Di Xia, Jonathan Richard, Priti Kumar, Walther Mothes, Marceline Côté, Pradeep D. Uchil, Vincent‐Philippe Lavallée, Martin A. Smith, Marzena Pazgier, Élie Haddad, Andrés Finzi

Notice bibliographique

RevueiScience · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSARS-CoV-2 and COVID-19 Research
Établissements canadiensUniversity of OttawaCentre Hospitalier Universitaire Sainte-JustineUniversité de MontréalMcGill UniversityCentre Hospitalier de l’Université de Montréal
Organismes subventionnairesInstitute of Infection and ImmunityBasic Energy SciencesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesNational Institute of General Medical SciencesU.S. Military HIV Research ProgramCanadian Institutes of Health ResearchUniformed Services University of the Health SciencesOffice of ScienceNational Institutes of HealthWorld Meteorological OrganizationNational Research Council CanadaMinistère de l'Économie, de l’Innovation et des Exportations du QuébecFonds de Recherche du Québec - SantéMitacsMinistère de la Santé et des Services sociauxGenome CanadaCanada Foundation for InnovationBiological and Environmental ResearchFondation du CHUMSLAC National Accelerator LaboratoryCRC Health GroupArgonne National LaboratoryU.S. Department of Energy
Mots-clésEpitopeAntibodyVirologyNeutralizationIn vivoIn vitroEpitope mappingSevere acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2)BiologyChemistryCoronavirus disease 2019 (COVID-19)ImmunologyMedicineBiochemistryGeneticsInfectious disease (medical specialty)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Neutralizing antibodies (NAbs) hold great promise for clinical interventions against SARS-CoV-2 variants of concern (VOCs). Understanding NAb epitope-dependent antiviral mechanisms is crucial for developing vaccines and therapeutics against VOCs. Here we characterized two potent NAbs, EH3 and EH8, isolated from an unvaccinated pediatric patient with exceptional plasma neutralization activity. EH3 and EH8 cross-neutralize the early VOCs and mediate strong Fc-dependent effector activity in vitro . Structural analyses of EH3 and EH8 in complex with the receptor-binding domain (RBD) revealed the molecular determinants of the epitope-driven protection and VOC evasion. While EH3 represents the prevalent IGHV3-53 NAb whose epitope substantially overlaps with the ACE2 binding site, EH8 recognizes a narrow epitope exposed in both RBD-up and RBD-down conformations. When tested in vivo, a single-dose prophylactic administration of EH3 fully protected stringent K18-hACE2 mice from lethal challenge with Delta VOC. Our study demonstrates that protective NAbs responses converge in pediatric and adult SARS-CoV-2 patients.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,054
Tête enseignante GPT0,378
Écart entre enseignants0,324 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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