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Enregistrement W4311309897 · doi:10.1016/j.celrep.2022.111822

A specific type of Argonaute phosphorylation regulates binding to microRNAs during C. elegans development

2022· article· en· W4311309897 sur OpenAlexafffund
Miguel Quévillon Huberdeau, Vivek Nilesh Shah, Smita Nahar, Julia Neumeier, François Houle, Astrid Bruckmann, Foivos Gypas, Kotaro Nakanishi, Helge Großhans, Gunter Meister, Martin J. Simard

Notice bibliographique

RevueCell Reports · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetics, Aging, and Longevity in Model Organisms
Établissements canadiensUniversité Laval
Organismes subventionnairesH2020 Marie Skłodowska-Curie ActionsNational Institute of General Medical SciencesFonds de Recherche du Québec - SantéCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of HealthNovartis FoundationSchweizerischer Nationalfonds zur Förderung der Wissenschaftlichen ForschungDeutsche Forschungsgemeinschaft
Mots-clésArgonautemicroRNAPhosphorylationBiologyGene silencingCell biologyCaenorhabditis elegansSerineKinaseGeneticsRNA interferenceGeneRNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Argonaute proteins are at the core of the microRNA-mediated gene silencing pathway essential for animals. In C. elegans, the microRNA-specific Argonautes ALG-1 and ALG-2 regulate multiple processes required for proper animal developmental timing and viability. Here we identified a phosphorylation site on ALG-1 that modulates microRNA association. Mutating ALG-1 serine 642 into a phospho-mimicking residue impairs microRNA binding and causes embryonic lethality and post-embryonic phenotypes that are consistent with alteration of microRNA functions. Monitoring microRNA levels in alg-1 phosphorylation mutant animals shows that microRNA passenger strands increase in abundance but are not preferentially loaded into ALG-1, indicating that the miRNA binding defects could lead to microRNA duplex accumulation. Our genetic and biochemical experiments support protein kinase A (PKA) KIN-1 as the putative kinase that phosphorylates ALG-1 serine 642. Our data indicate that PKA triggers ALG-1 phosphorylation to regulate its microRNA association during C. elegans development.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,061
Score d'incertitude au seuil0,580

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,213
Écart entre enseignants0,202 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations18
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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