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Enregistrement W4311517699 · doi:10.1002/imt2.66

Deciphering factors driving soil microbial life‐history strategies in restored grasslands

2022· article· en· W4311517699 sur OpenAlexaff
Yanxing Dou, Baorong Wang, Zhijing Xue, Yunqiang Wang, Shaoshan An, Scott X. Chang

Notice bibliographique

RevueiMeta · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenomics and Phylogenetic Studies
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesNatural Science Foundation of Shaanxi ProvinceState Key Laboratory of Loess and Quaternary GeologyChinese Academy of Sciences
Mots-clésAcidobacteriaBiologyChronosequencePlanctomycetesProteobacteriaActinobacteriaMicrobial population biologyBacteroidetesGrasslandEcologyMicrobial ecologyBotanyEcosystemBacteria16S ribosomal RNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract In macroecology, the concept of r‐ and K‐strategy has been widely applied, yet, there have been limited studies on microbial life‐history strategies in temperate grasslands using multiple sequencing approaches. Total phospholipid fatty acid (PLFA) analysis, high‐throughput meta‐genomic sequencing, and GeoChip technologies were used to examine the changes in microbial life‐history traits in a chronosequence of restored grasslands (1, 5, 10, 15, 25, and 30 years since restoration). Grassland restoration increased the relative abundances of Actinobacteria, Proteobacteria, and Bacteroidetes but reduced the relative abundances of Acidobacteria, Planctomycetes, and Chloroflexi. PLFA analysis revealed that grassland restoration reduced the fungi:bacteria and Gram‐positive:Gram‐negative bacteria ratios. Combined with the meta‐genomic data, we found that grassland restoration shifted microorganisms from oligotrophic (K‐) to copiotrophic (r‐) groups, consistent with the increased rRNA operon copy number of the microbial community. Structural equation modeling showed that soil properties positively ( p < 0.05) while plant properties negatively ( p < 0.05) affected microbial life‐history traits. We built a framework to highlight the importance of plant and soil properties in driving microbial life‐history traits during grassland restoration. Finally, by incorporating meta‐genomic and other microbiological data, this study showed that microbial life‐history traits support the idea that rRNA operon copy number is a trait that reflects resource availability to soil microorganisms.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,879
Score d'incertitude au seuil0,573

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,221
Écart entre enseignants0,204 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations294
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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