Associations between <i>ALOX5</i> and <i>ALOX5AP</i> Genetic Polymorphisms and Cognitive Performance in Patients with Alzheimer’s Dementia and Mild Cognitive Impairment
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Background Leukotriene activity may contribute to cognitive deficits in Alzheimer’s disease (AD). Leukotrienes are synthesized by 5‐lipoxygenase (5‐LOX) and its activating protein (FLAP), encoded by ALOX5 and ALOX5AP, respectively. This cross‐sectional study investigated the associations of ALOX5 and ALOX5AP single nucleotide polymorphisms (SNPs) with cognitive performance in patients with AD or mild cognitive impairment (MCI). Method ALOX5 SNP rs2029253 and ALOX5AP SNPs rs10507391, rs12429692, rs4147064, rs9551963, rs9579646 were selected based on previous associations to ischemic stroke. Participants in the Alzheimer’s Disease Neuroimaging Initiative (ADNI) diagnosed with AD or MCI at baseline were separated by genotype for each SNP. Rey Auditory Verbal Learning Test (RAVLT), Mini Mental State Exam (MMSE), and Trail Making Part B (TRAB) tests were selected to measure memory, overall cognitive status, and executive function, respectively. Associations between SNPs and white matter hyperintensities (WMH) were also explored. Additive, dominant, and recessive models were tested for each SNP and outcome pair. Linear regressions were used to assess associations between genotypes and outcomes controlling for age, sex, and education. Result rs12429692 TT homozygotes (MAF = 25.3%) had lower RAVLT learning (i.e. Trial 5 minus Trial 1) scores (F1,508 = 7.19, p = 0.008, n = 513, recessive model). rs4147064 TC heterozygotes (MAF = 46.5%) had higher MMSE scores than TT homozygotes (F2,508 = 3.34, p = 0.036, n = 514, additive model). rs9551963 CC homozygotes (MAF = 49.1%) had higher TRAB times (F1,481 = 6.06, p = 0.014, n = 486, recessive model). Split by sex, rs12429692 was associated with TRAB times in males (F1,277 = 5.52, p = 0.020, n = 281, dominant model) and rs9551963 was associated with RAVLT % forgetting scores in females (F1,212 = 4.98, p = 0.027, n = 216, recessive model). The rs12429692 A/T SNP (MAF = 25.4%) trended towards an association with WMH (F1,507 = 3.33, p = 0.069, n = 512, recessive model). Conclusion Three ALOX5AP SNPs were associated with aspects of cognitive performance. This preliminary clinical evidence suggests a possible effect of leukotriene synthesis on cognition in patients with AD or MCI.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».