LDLR, VLDLR and APOBR in the pathophysiology of sporadic Alzheimer’s disease
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Background Alzheimer’s disease (AD) and cholesterol homeostasis have long been linked, most notably by the identification of apolipoprotein E‐ε4 allele as the strongest risk factor. Yet the mechanism by which its pathogenic isoform ε4 impacts AD has remained elusive. Different GWA studies have identified other potential risk factors, many of which are also involved in the maintenance, homeostasis, mobilisation, and distribution of cholesterol. The aim of this study was to analyse three candidate genes involved in cholesterol metabolism, which showed preliminary significance and are strongly related to cholesterol processes and APOE neurobiology. Method The three candidates are the receptors LDLR, VLDLR and APOBR which were analysed using neocortical mRNA data from the Religious Orders study/ Memory and Aging Project ROSMAP cohort’s dataset. The receptor mRNA levels were contrasted against several AD pathological markers, such as Braak and CERAD stages. Other apolipoprotein mRNA levels were also analysed for significance. Age, Sex and ApoE4 genotype were also tested for effect. Result Preliminary analyses showed significant correlation between mRNA levels of these receptors (most strongly VLDLR) and Braak stages (VLDLR p < 0.008), CERAD stages (VLDLR p < 0.001) as well as several proteins known to be involved in AD pathophysiology. VLDLR expression levels did not correlate with APOE mRNA levels (VLDLR; R2=0.176, p > 0.05) and were only significant in APOε4 negative subjects when split for APOε4 genotype (VLDLR Braak p < 0.003). Conclusion The three receptors analysed so far appear to be involved at some level with AD pathophysiology. They will be further studied and investigated in both, symptomatic and pre‐symptomatic AD. The relationship between the receptors and APOE pathophysiology in sporadic AD remains unclear.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».