Phylogenomics Reveals that Mitochondrial Capture and Nuclear Introgression Characterize Skua Species Proposed to be of Hybrid Origin
Notice bibliographique
Résumé
The skuas and jaegers (Stercorariidae) are an enigmatic family of seven seabird species that breed at Arctic and Antarctic latitudes. The phylogenetic relationships amongst the species have been controversial, with one of the biggest enigmas involving the Pomarine Jaeger (Stercorarius pomarinus), which has been proposed to represent a hybrid species originating from the merging of distant lineages within the complex. We inferred a phylogeny for the family using multispecies coalescent methods with whole-genome sequencing for all seven species of Stercorariidae, and document an evolutionary history rich in introgression. We uncover evidence for mitochondrial capture and nuclear introgression between S. pomarinus and Stercorarius skua, providing a potential avenue for adaptive introgression. One candidate for adaptive introgression is the MC1R plumage gene which appears to have introgressed from one of the large skuas into S. pomarinus, where it now forms the basis of the dark-morph color polymorphism of that species. We further highlight a complex biogeographical history of interchange between the Arctic and Antarctic, with unexpected close ancestry between S. skua of the northern hemisphere and Stercorarius antarcticus of the southern hemisphere. These results highlight the dynamic history of introgression during pelagic seabird radiation. [Incomplete lineage sorting; introgression; mitochondrial capture; phylogenomics; skua; species tree; stercorariidae; whole-genome resequencing.].
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
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Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».