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Enregistrement W4312113941 · doi:10.1161/circgen.121.003641

Rationale, Design, and the Baseline Characteristics of the RHDGen (The Genetics of Rheumatic Heart Disease) Network Study†

2022· article· en· W4312113941 sur OpenAlexafffund
Tafadzwa Machipisa, Chishala Chishala, Gasnat Shaboodien, Liesl Zühlke, Babu Muhamed, Shahiemah Pandie, Jantina de Vries, Nakita Laing, Alexia Joachim, Rezeen Daniels, Mpiko Ntsekhe, Christopher Hugo‐Hamman, Bernard Gitura, Stephen Ogendo, Peter Lwabi, Emmy Okello, Albertino Damasceno, Célia Novela, Ana Olga Mocumbi, Geoffrey Madeira, John Musuku, Agnes Mtaja, Ahmed ElSayed, Huda H.M. Alhassan, Fidelia Bode-Thomas, Christopher Sabo Yilgwan, Ganiyu Amusa, Esin Nkereuwem, Nicola Mulder, Raj Ramesar, Maia Lesosky, Heather J. Cordell, Michael Chong, Bernard Keavney, Guillaume Paré, Mark E. Engel

Notice bibliographique

RevueCirculation Genomic and Precision Medicine · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueStreptococcal Infections and Treatments
Établissements canadiensHamilton Health SciencesThrombosis and Atherosclerosis Research InstituteMcMaster UniversityPopulation Health Research Institute
Organismes subventionnairesDivision of Research Capacity DevelopmentMedical Research CouncilNational Research FoundationBritish Heart FoundationWellcome TrustSouth African Medical Research CouncilCanadian Institutes of Health ResearchAmerican Heart AssociationEconomic and Social Research CouncilSanofiDepartment for International DevelopmentBristol-Myers SquibbMcMaster UniversityAmgenCisco Systems
Mots-clésMedicineGenome-wide association studyProbandHeart diseaseCase-control studyDiseaseInternal medicineGeneticsGenotypeBiologySingle-nucleotide polymorphism

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: The genetics of rheumatic heart disease (RHDGen) Network was developed to assist the discovery and validation of genetic variations and biomarkers of risk for rheumatic heart disease (RHD) in continental Africans, as a part of the global fight to control and eradicate rheumatic fever/RHD. Thus, we describe the rationale and design of the RHDGen study, comprising participants from 8 African countries. METHODS: RHDGen screened potential participants using echocardiography, thereafter enrolling RHD cases and ethnically-matched controls for whom case characteristics were documented. Biological samples were collected for conducting genetic analyses, including a discovery case-control genome-wide association study (GWAS) and a replication trio family study. Additional biological samples were also collected, and processed, for the measurement of biomarker analytes and the biomarker analyses are underway. RESULTS: Participants were enrolled into RHDGen between December 2012 and March 2018. For GWAS, 2548 RHD cases and 2261 controls (3301 women [69%]; mean age [SD], 37 [16.3] years) were available. RHD cases were predominantly Black (66%), Admixed (24%), and other ethnicities (10%). Among RHD cases, 34% were asymptomatic, 26% had prior valve surgery, and 23% had atrial fibrillation. The trio family replication arm included 116 RHD trio probands and 232 parents. CONCLUSIONS: RHDGen presents a rare opportunity to identify relevant patterns of genetic factors and biomarkers in Africans that may be associated with differential RHD risk. Furthermore, the RHDGen Network provides a platform for further work on fully elucidating the causes and mechanisms associated with RHD susceptibility and development.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,024
Score d'incertitude au seuil0,274

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,031
Tête enseignante GPT0,276
Écart entre enseignants0,245 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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