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Enregistrement W4312126068 · doi:10.3390/ijms232415742

The J Domain of Sacsin Disrupts Intermediate Filament Assembly

2022· article· en· W4312126068 sur OpenAlexafffundabout
Afrooz Dabbaghizadeh, Alexandre Paré, Zacharie Cheng-Boivin, Robin Dagher, Sandra Minotti, Marie‐Josée Dicaire, Bernard Brais, Jason C. Young, Heather D. Durham, Benoît J. Gentil

Notice bibliographique

RevueInternational Journal of Molecular Sciences · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueHeat shock proteins research
Établissements canadiensMcGill UniversityMontreal Neurological Institute and Hospital
Organismes subventionnairesMuscular Dystrophy CanadaMcGill University
Mots-clésIntermediate filamentVimentinCell biologyNeurofilamentRegulatorBiologyProtein filamentIntermediate Filament ProteinProtein domainChemistryGeneCytoskeletonCellBiochemistryImmunology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Autosomal Recessive Spastic Ataxia of the Charlevoix Saguenay (ARSACS) is caused by mutation in the SACS gene resulting in loss of function of the protein sacsin. A key feature is the formation of abnormal bundles of neurofilaments (NF) in neurons and vimentin intermediate filaments (IF) in cultured fibroblasts, suggesting a role of sacsin in IF homeostasis. Sacsin contains a J domain (SacsJ) homologous to Hsp40, that can interact with Hsp70 chaperones. The SacsJ domain resolved NF bundles in cultured Sacs−/− neurons. Having studied the mechanism using NF assembled in vitro from purified NF proteins, we report that the SacsJ domain interacts with NF proteins to disassemble NFL filaments, and to inhibit their initial assembly. A cell-penetrating peptide derived from this domain, SacsJ-myc-TAT was efficient in disassembling NF bundles in cultured Sacs−/− motor neurons, restoring the NF network; however, there was some loss of vimentin IF and NF in cultured Sacs+/+ fibroblasts and motor neurons, respectively. These results suggest that sacsin through its SacsJ domain is a key regulator of NF and vimentin IF networks in cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,327
Écart entre enseignants0,313 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations14
Publié2022
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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