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Enregistrement W4312129642 · doi:10.1186/s13071-022-05571-6

Genetic polymorphism, constitutive expression and tissue localization of Dirofilaria immitis P-glycoprotein 11: a putative marker of macrocyclic lactone resistance

2022· article· en· W4312129642 sur OpenAlexafffund
Emily Curry, Roger K. Prichard, Anne Lespine

Notice bibliographique

RevueParasites & Vectors · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueParasitic Diseases Research and Treatment
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaUniversity of Georgia
Mots-clésDirofilaria immitisBiologySingle-nucleotide polymorphismMicrofilariaSNPMolecular biologyGeneGeneticsGenotypeImmunologyHelminthsFilariasis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Dirofilaria immitis causes dirofilariosis, a potentially fatal condition in canids. Dirofilaria infections can be prevented with a macrocyclic lactone (ML) prophylactic regimen. However, some D. immitis isolates have become resistant to MLs. Genetic changes on the P-glycoprotein 11 gene, encoding an ABCB transporter, have been linked to the ML-resistant phenotypes and have been proposed as markers of drug resistance. However, nothing is known about the expression and the localization of this transporter in D. immitis, despite its strong link to ML-resistant phenotypes. METHODS: We examined the clinically validated D. immitis P-glycoprotein 11 (DimPgp-11) single nucleotide polymorphism (SNP) via MiSeq analysis in three ML-susceptible isolates (Missouri, MP3 and Yazoo) and two ML-resistant isolates (JYD-34 and Metairie), and correlated the data with previously published MiSeq results of USA laboratory-maintained D. immitis isolates. The level of the expression of the DimPgp-11 messenger RNA transcript was analyzed by droplet digital PCR (ddPCR) and compared in the USA laboratory-maintained isolates, namely the ML-susceptible Missouri and Berkeley isolates, the putative ML-susceptible Georgia III and Big Head isolates and the ML-resistant isolate JYD-34. The immunolocalization of DimPgp-11 was visualized in the microfilaria (mf) life stage of the Missouri isolate using confocal microscopy. RESULTS: The results confirmed that the SNP found on DimPgp-11 is differentially expressed in the USA laboratory-maintained isolates. The ML-susceptible isolates had an alternate allele frequency of between 0% and 15%, while it ranged between 17% and 56% in the ML-resistant isolates. The constitutive expression of DimPgp-11 was similar in the Berkeley, Georgia III and Big Head isolates, while it was significantly decreased in the ML-resistant JYD-34 isolate (P < 0.05), when compared to the ML-susceptible Missouri isolate. The DimPgp-11 protein was distinctly localized within the excretory-secretory (ES) duct, pore cells and the excretory cell and, more faintly, along the mf body wall. CONCLUSION: Our data confirm that genetic polymorphism of DimPgp-11 is associated with ML resistance in USA laboratory-maintained D. imminits isolates. A link between DimPgp-11 and ML resistance in D. immitis is further supported by the lower protein expression in the ML-resistant JYD-34 isolate when compared with the ML-susceptible Missouri isolate. Interestingly, DimPgp-11 is strategically located surrounding the ES pore where it could play an active role in ML efflux.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,104
Score d'incertitude au seuil0,685

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,286
Écart entre enseignants0,277 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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