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Enregistrement W4312175608 · doi:10.3390/cells12010039

Rescue of Misfolded Organic Cation Transporter 3 Variants

2022· article· en· W4312175608 sur OpenAlexaff
Thomas J. F. Angenoorth, Julian Maier, Stevan Stankovic, Shreyas Bhat, Sonja Sučić, Michael Freissmuth, Harald H. Sitte, Jae‐Won Yang

Notice bibliographique

RevueCells · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueDrug Transport and Resistance Mechanisms
Établissements canadiensUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesAustrian Science Fund
Mots-clésChemical chaperoneTransporterOrganic cation transport proteinsSolute carrier familyChemistryChaperone (clinical)Transport proteinProtein foldingSymporterCell biologyBiochemistryBiologyGeneUnfolded protein responseMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Organic cation transporters (OCTs) are membrane proteins that take up monoamines, cationic drugs and xenobiotics. We previously reported novel missense mutations of organic cation transporter 3 (OCT3, SLC22A3), some with drastically impacted transport capabilities compared to wildtype. For some variants, this was due to ER retention and subsequent degradation of the misfolded transporter. For other transporter families, it was previously shown that treatment of misfolded variants with pharmacological and chemical chaperones could restore transport function to a certain degree. To investigate two potentially ER-bound, misfolded variants (D340G and R348W), we employed confocal and biochemical analyses. In addition, radiotracer uptake assays were conducted to assess whether pre-treatment with chaperones could restore transporter function. We show that pre-treatment of cells with the chemical chaperone 4-PBA (4-phenyl butyric acid) leads to increased membrane expression of misfolded variants and is associated with increased transport capacity of D340G (8-fold) and R348W (1.5 times) compared to untreated variants. We herein present proof of principle that folding-deficient SLC22 transporter variants, in particular those of OCT3, are amenable to rescue by chaperones. These findings need to be extended to other SLC22 members with corroborated disease associations.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,208
Écart entre enseignants0,199 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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