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Enregistrement W4312224038 · doi:10.3389/ffgc.2022.1068135

Benchmarking a fast and simple on-site detection assay for the oak wilt pathogen Bretziella fagacearum

2022· article· en· W4312224038 sur OpenAlex
Émilie Bourgault, Marie‐Krystel Gauthier, Amélie Potvin, Don Stewart, Karandeep Chahal, Monique L. Sakalidis, Philippe Tanguay

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.
aboutLe titre ou le résumé porte un signal canadien du lexique géographique.

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Forests and Global Change · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueForest Insect Ecology and Management
Établissements canadiensNatural Resources CanadaCanadian Forest Service
Organismes subventionnairesNatural Resources Canada
Mots-clésWilt diseaseTaqManBiologyBacterial wiltDiagnostic testVeterinary medicineHorticulturePolymerase chain reactionMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Oak wilt is a vascular disease of oak trees caused by the fungus Bretziella fagacearum . Once infected, trees may die in a few weeks. Although the disease is currently only found in the United States, it has been reported within just a few hundred meters of the Canada–USA border. To limit the establishment and spread of oak wilt in Canada, the development of an on-site, quick and reliable method to detect B. fagacearum is critical. In this study, we developed and validated a new qPCR TaqMan ® assay that can detect B. fagacearum in a laboratory setting with great specificity and sensitivity. Using this test as a reference, we also developed and validated a new DETECTR assay that can detect B. fagacearum under 1 h from a variety of environmental samples, such as mycelium mats and insect vectors, using minimal laboratory equipment. While there are still some limitations to the sensitivity of this assay, we believe that its ease of use, flexibility and accuracy will provide an essential tool in efforts to reduce the spread of oak wilt.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,241
Score d'incertitude au seuil0,375

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,216
Écart entre enseignants0,204 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle