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Enregistrement W4312949834 · doi:10.17072/1994-9952-2022-4-288-293

Results of detection of poly-virulent bacterial strains Lactobacillus spp. during associative interaction with protozoa Blastocystis ho-minis in vivo

2022· article· en· W4312949834 sur OpenAlexaff
Yulia Yu. Krasnoperova, Sevinj Sh. Mehmanova, Ekaterina A. Khusnutdinova

Notice bibliographique

RevueВестник Пермского университета Серия «Биология»=Bulletin of Perm University Biology · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueParasitic Infections and Diagnostics
Établissements canadiensArtificial Intelligence in Medicine (Canada)
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésVirulenceMicrobiologyBiologyBlastocystisLactobacillusFimbriaProtozoaBacterial adhesinPopulationLactobacillus reuteriLactobacillus caseiBacteriaFecesGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The identification of polyvirulent strains of Lactobacillus spp. bacteria with associative interaction with protozoa Blastocystis hominis in vivo was carried out. Lactobacillus spp. and B. hominis strains were obtained from the feces of 396 patients undergoing examination for intestinal dysbiosis. Identification was carried out using microscopic, bacteriological and parasitological methods. 112 reference strains of lactobacilli NK1 and K3SH24 deposited at the Institute of Genetics and Breeding of Industrial Microorganisms were used as control. The degree of virulence of the simplest blastocysts was determined by intraperitoneal administration to white mice (weighing 17.4+1.5 g) 0.5 ml of a culture suspension of the studied microorganisms grown on Suresh medium. Primers to several genes determining the ability to form type 1 fimbriae, type S and P fimbriae, bacterial adhesin intimin and hemolysin were used in the investigation. Testing of 396 Lactobacillus spp. strains isolated from microsymbiocenoses with Blastocystis hominis of varying degrees of virulence showed that the dynamics of detection of pathogenicity genes in lactobacilli increased with an increase in the degree of virulence of protozoa. Most often, in the general pool of lactobacillus strains, the desired amplicons were detected using primers to the fimA gene (up to 67.9%). During associative interaction with moderately and highly virulent blastocysts, an increase in the heterogeneity of the lactobacillus population was revealed, manifested by an increase in the frequency of detection of all studied genetic determinants of pathogenicity, compared with Lactobacillus spp. strains isolated from associations with avirulent B. hominis and in the control group.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,208
Écart entre enseignants0,201 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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