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Enregistrement W4313020967 · doi:10.33590/emjoncol/10311156

A Review of Gene Expression Profiling in Early-Stage ER+/HER2- Breast Cancer With A Focus on The PAM50 Risk of Recurrence Assay

2019· review· en· W4313020967 sur OpenAlexaff
Malek B. Hannouf, Christine Brezden‐Masley, Jacques Raphael, Muriel Brackstone

Notice bibliographique

RevueEMJ Oncology · 2019
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBreast Cancer Treatment Studies
Établissements canadiensUniversity of TorontoSt. Michael's HospitalWestern University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBreast cancerMedicineOncologyInternal medicineAdjuvantStage (stratigraphy)Adjuvant therapyCancerGynecologyBioinformaticsBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In patients with breast cancer, the expression of oestrogen receptor, progesterone receptor, and human epidermal growth factor 2 (HER2) is used as a molecular marker to determine prognosis and direct treatment decisions; however, this does not fully reflect the molecular complexity of the disease. Patients with early-stage hormone receptor-positive (ER+), HER2-negative (HER2-) breast cancer are typically treated with surgery, followed by adjuvant systemic endocrine therapy with or without adjuvant radiation therapy. Gene expression profiling assays complement clinicopathological parameters, such as tumour size, grade, and nodal status, and can be used to classify risk of recurrence, thereby informing adjuvant therapy decision-making in early-stage breast cancer to prevent unnecessary treatment with chemotherapy in low risk patients. In this review, the authors evaluate the evidence to date supporting the use of one of the tests, the Prosigna PAM50 risk of recurrence assay (Nanostring, Seattle, Washington, USA), as a prognostic tool in ER+/HER2- early-stage breast cancer, and summarise findings from a clinical and cost-effectiveness analysis performed by the National Institute for Health and Care Excellence (NICE) in the UK. The authors also focus on recommendations from regulatory bodies and key ongoing research efforts to address the remaining uncertainty regarding the application of available genomic signatures in ER+/HER2- early-stage breast cancer.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Autre devis · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,938
Score d'incertitude au seuil0,930

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,038
Tête enseignante GPT0,355
Écart entre enseignants0,318 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeAutre devis
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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