MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4313196624 · doi:10.2196/38861

A Linked Open Data–Based Terminology to Describe Libre/Free and Open-source Software: Incremental Development Study

2022· article· en· W4313196624 sur OpenAlexvenueno aff
Franziska Jahn, Elske Ammenwerth, Verena Dornauer, Konrad Höffner, Michelle Bindel, Thomas Karopka, Alfred Winter

Notice bibliographique

RevueJMIR Medical Informatics · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueOpen Source Software Innovations
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesUniversität LeipzigAustrian Science FundDeutsche Forschungsgemeinschaft
Mots-clésComputer scienceSoftwareDomain (mathematical analysis)Product (mathematics)TerminologyHealth informaticsData scienceWorld Wide WebKnowledge managementSoftware engineeringHealth care

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: There is a variety of libre/free and open-source software (LIFOSS) products for medicine and health care. To support health care and IT professionals select an appropriate software product for given tasks, several comparison studies and web platforms, such as Medfloss.org, are available. However, due to the lack of a uniform terminology for health informatics, ambiguous or imprecise terms are used to describe the functionalities of LIFOSS. This makes comparisons of LIFOSS difficult and may lead to inappropriate software selection decisions. Using Linked Open Data (LOD) promises to address these challenges. OBJECTIVE: We describe LIFOSS systematically with the help of the underlying Health Information Technology Ontology (HITO). We publish HITO and HITO-based software product descriptions using LOD to obtain the following benefits: (1) linking and reusing existing terminologies and (2) using Semantic Web tools for viewing and querying the LIFOSS data on the World Wide Web. METHODS: HITO was incrementally developed and implemented. First, classes for the description of software products in health IT evaluation studies were identified. Second, requirements for describing LIFOSS were elicited by interviewing domain experts. Third, to describe domain-specific functionalities of software products, existing catalogues of features and enterprise functions were analyzed and integrated into the HITO knowledge base. As a proof of concept, HITO was used to describe 25 LIFOSS products. RESULTS: HITO provides a defined set of classes and their relationships to describe LIFOSS in medicine and health care. With the help of linked or integrated catalogues for languages, programming languages, licenses, features, and enterprise functions, the functionalities of LIFOSS can be precisely described and compared. We publish HITO and the LIFOSS descriptions as LOD; they can be queried and viewed using different Semantic Web tools, such as Resource Description Framework (RDF) browsers, SPARQL Protocol and RDF Query Language (SPARQL) queries, and faceted searches. The advantages of providing HITO as LOD are demonstrated by practical examples. CONCLUSIONS: HITO is a building block to achieving unambiguous communication among health IT professionals and researchers. Providing LIFOSS product information as LOD enables barrier-free and easy access to data that are often hidden in user manuals of software products or are not available at all. Efforts to establish a unique terminology of medical and health informatics should be further supported and continued.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Étiquettes directes de modèles (non validées)

Étiquettes de catégorie et de devis d'étude par modèle, issues des rondes d'étiquetage. C'est une sortie machine, non validée, et le désaccord entre modèles est livré comme donnée. Aucun devis ici n'est encore validé contre MEDLINE.

BrasCatégoriesDevis d'étudeConfiance
gemmaCommunication savante
Domaine: non disponible · Genre: Méthodes
Porte sur le système de recherche canadien: non · Porte sur un sujet canadien: non
Expérimental (laboratoire)high
gptaucune catégorie
Domaine: non disponible · Genre: Logiciel
Porte sur le système de recherche canadien: non · Porte sur un sujet canadien: non
Autre devishigh
modèles en désaccordL'accord compare des ensembles de catégories et des devis identiques entre les bras.

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,030
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,062
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCommunication savante, Science ouverte
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Qualitatif · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,997
Score d'incertitude au seuil0,159

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0300,062
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,002
Bibliométrie0,0140,017
Études des sciences et des technologies0,0020,005
Communication savante0,0070,019
Science ouverte0,0030,007
Intégrité de la recherche0,0020,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,072
Tête enseignante GPT0,340
Écart entre enseignants0,268 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Étiqueté directement par 2 modèles lisant le dossier complet.

Communication savante

Les modèles divergent sur des parties de cette classification; chaque voix est préservée dans la section en fin de page.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire) · Autre devis
Domainenon disponible
GenreMéthodes · Logiciel

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJMIR Medical InformaticsMême sujetOpen Source Software InnovationsCatégorieCommunication savanteTravaux en français237 207