MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4313251504 · doi:10.1038/s41392-022-01239-w

SARS-CoV-2 hijacks cellular kinase CDK2 to promote viral RNA synthesis

2022· article· en· W4313251504 sur OpenAlexaff
Saisai Guo, Xiaobo Lei, Yan Chang, Jianyuan Zhao, Jing Wang, Xiaojing Dong, Qian Liu, Zixiong Zhang, Lidan Wang, Dongrong Yi, Ling Ma, Quanjie Li, Yongxin Zhang, Jiwei Ding, Chen Liang, Xiaoyu Li, Fei Guo, Jianwei Wang, Shan Cen

Notice bibliographique

RevueSignal Transduction and Targeted Therapy · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSARS-CoV-2 and COVID-19 Research
Établissements canadiensMcGill UniversityJewish General Hospital
Organismes subventionnairesFundamental Research Funds for the Central UniversitiesNational Medical Research CouncilNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésBiologyRNAKinaseCyclin-dependent kinase 2VirologyCoronaviridaeViral replicationRNA-dependent RNA polymeraseCell biologySubgenomic mRNACoronavirus disease 2019 (COVID-19)GeneticsVirusProtein kinase AGeneDisease

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The coronavirus disease 2019 (COVID-19) pandemic has devastated global health. Identifying key host factors essential for SARS-CoV-2 RNA replication is expected to unravel cellular targets for the development of broad-spectrum antiviral drugs which have been quested for the preparedness of future viral outbreaks. Here, we have identified host proteins that associate with nonstructural protein 12 (nsp12), the RNA-dependent RNA polymerase (RdRp) of SARS-CoV-2 using a mass spectrometry (MS)-based proteomic approach. Among the candidate factors, CDK2 (Cyclin-dependent kinase 2), a member of cyclin-dependent kinases, interacts with nsp12 and causes its phosphorylation at T20, thus facilitating the assembly of the RdRp complex consisting of nsp12, nsp7 and nsp8 and promoting efficient synthesis of viral RNA. The crucial role of CDK2 in viral RdRp function is further supported by our observation that CDK2 inhibitors potently impair viral RNA synthesis and SARS-CoV-2 infection. Taken together, we have discovered CDK2 as a key host factor of SARS-CoV-2 RdRp complex, thus serving a promising target for the development of SARS-CoV-2 RdRp inhibitors.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,037
Tête enseignante GPT0,304
Écart entre enseignants0,267 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations25
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueSignal Transduction and Targeted TherapyMême sujetSARS-CoV-2 and COVID-19 ResearchTravaux en français237 207