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Enregistrement W4313309314 · doi:10.1101/2022.12.14.22283419

Using Social Media to Help Understand Long COVID Patient Reported Health Outcomes: A Natural Language Processing Approach

2022· preprint· en· W4313309314 sur OpenAlexaff
Elham Dolatabadi, Diana Moyano, Michael Bales, Sofija Spasojević, Rohan Bhambhoria, Junaid A. Bhatti, Shyamolima Debnath, Nicholas Hoell, Xin Li, Celine Leng, Sasha Nanda, Jad Saab, Esmat Sahak, Fanny Sie, Sara Uppal, Nirma Khatri Vadlamudi, Antoaneta Vladimirova, Artur Yakimovich, Xiaoxue Yang, Sedef Akinli Koçak, Angela M. Cheung

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2022
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRespiratory and Cough-Related Research
Établissements canadiensUniversity of British ColumbiaTelus (Canada)Queen's UniversityRoche (Canada)Vector InstituteUniversity Health NetworkUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSocial mediaAnxietyHeadachesMedicineCoronavirus disease 2019 (COVID-19)DistressPsychologyDiseasePsychiatryClinical psychologyInfectious disease (medical specialty)Computer sciencePathologyWorld Wide Web

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background There remains significant uncertainty in the definition of the long COVID disease, its expected clinical course, and its impact on daily functioning. Social media platforms can generate valuable insights into patient-reported health outcomes as the content is produced at high resolution by patients and caregivers, representing experiences that may be unavailable to most clinicians. Objective We aim to determine the validity and effectiveness of advanced NLP approaches built to derive insight into Long COVID-related patient-reported health outcomes from social media platforms. Methodology We use Transformer-based BERT models to extract and normalize long COVID Symptoms and Conditions (SyCo) from English posts on Twitter and Reddit. Furthermore, we estimate the occurrence and co-occurrence of SyCo terms at any point or across time and locations. Finally, we compare the extracted health outcomes with human annotations and highly utilized clinical outcomes grounded in the medical literature. Result Based on our findings, the top three most commonly occurring groups of long COVID symptoms are systemic (such as “fatigue”), neuropsychiatric (such as “anxiety” and “brain fog”), and respiratory (such as “shortness of breath”). Regarding the co-occurring symptoms, the pair of ‘fatigue & headaches’ is most common. In addition, we show that other conditions, such as infection, hair loss, and weight loss, as well as mentions of other diseases, such as flu, cancer, or Lyme disease, are among the top reported terms by social media users. Conclusion The outcome of our social media-derived pipeline is comparable with the outcomes of peer-reviewed articles relevant to long COVID symptoms. Overall, this study provides unique insights into patient-reported health outcomes from long COVID and valuable information about the patient’s journey that can help healthcare providers anticipate future needs.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Intégrité de la recherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Qualitatif · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,151
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,166
Tête enseignante GPT0,413
Écart entre enseignants0,247 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeQualitatif
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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