MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4313312682 · doi:10.1111/petr.14460

Noninvasive testing for mycophenolate exposure in children with renal transplant using urinary metabolomics

2022· article· en· W4313312682 sur OpenAlexafffund
Khalid Taha, Atul Sharma, Kristine Kroeker, Colin J.D. Ross, Bruce Carleton, David S. Wishart, Mara Medeiros-Domingo, Tom Blydt‐Hansen

Notice bibliographique

RevuePediatric Transplantation · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRenal Transplantation Outcomes and Treatments
Établissements canadiensUniversity of AlbertaUniversity of ManitobaUniversity of British ColumbiaChildren's Hospital of WinnipegChildren's Hospital Research Institute of ManitobaGeorge & Fay Yee Centre for Healthcare InnovationBC Children's Hospital
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchKidney Foundation of Canada
Mots-clésMedicineUrineMetaboliteUrinary systemKidney transplantationTransplantationInternal medicineUrologyCohortProspective cohort study

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Despite the common use of mycophenolate in pediatric renal transplantation, lack of effective therapeuic drug monitoring increases uncertainty over optimal drug exposure and risk for adverse reactions. This study aims to develop a novel urine test to estimate MPA exposure based using metabolomics. METHODS: Urine samples obtained on the same day of MPA pharmacokinetic testing from two prospective cohorts of pediatric kidney transplant recipients were assayed for 133 unique metabolites by mass spectrometry. Partial least squares (PLS) discriminate analysis was used to develop a top 10 urinary metabolite classifier that estimates MPA exposure. An independent cohort was used to test pharmacodynamic validity for allograft inflammation (urinary CXCL10 levels) and eGFR ratio (12mo/1mo eGFR) at 1 year. RESULTS: Fifty-two urine samples from separate children (36.5% female, 12.0 ± 5.3 years at transplant) were evaluated at 1.6 ± 2.5 years post-transplant. Using all detected metabolites (n = 90), the classifier exhibited strong association with MPA AUC by principal component regression (r = 0.56, p < .001) and PLS (r = 0.75, p < .001). A practical classifier (top 10 metabolites; r = 0.64, p < .001) retained similar accuracy after cross-validation (LOOCV; r = 0.52, p < .001). When applied to an independent cohort (n = 97 patients, 1053 samples), estimated mean MPA exposure over Year 1 was inversely associated with mean urinary CXCL10:Cr (r = -0.28, 95% CI -0.45, -0.08) and exhibited a trend for association with eGFR ratio (r = 0.35, p = .07), over the same time period. CONCLUSIONS: This urinary metabolite classifier can estimate MPA exposure and correlates with allograft inflammation. Future studies with larger samples are required to validate and evaluate its clinical application.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,011
Score d'incertitude au seuil0,831

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,263
Écart entre enseignants0,237 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuePediatric TransplantationMême sujetRenal Transplantation Outcomes and TreatmentsTravaux en français237 207