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Enregistrement W4313332959 · doi:10.1055/a-2004-5883

A Robust, Gram-Scale and High-Yield Synthesis of MDP Congeners for Activation of the NOD2 Receptor and Vaccine Adjuvantation

2022· article· en· W4313332959 sur OpenAlexaff
Farooq‐Ahmad Khan, Sana Yaqoob, Muhammad Qasim, Yan Wang, Zi‐Hua Jiang, Shujaat Ali

Notice bibliographique

RevueSynthesis · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueChemical Synthesis and Analysis
Établissements canadiensLakehead University
Organismes subventionnairesPakistan Science Foundation
Mots-clésMuramyl dipeptideChemistryNOD2PharmacophorePeptidoglycanImmunogenicityAdjuvantGlycanInnate immune systemImmune systemMoietyReceptorBiochemistryMicrobiologyIn vitroStereochemistryEnzymeBiologyImmunology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The bacterial peptidoglycan (PGN) constituent muramyl dipeptide (MDP) and its congeners possess immuno-adjuvant activity, and find applications in vaccines to potentiate the immune response of antigens. It confers non-specific resistance towards pathogenic infections and defense against tumors. In this work, the parent MDP molecule is re-designed by replacing its carbohydrate moiety with an immunoregulatory xanthine scaffold, while conserving the l-d configuration of the pharmacophore. Alkyl chains are introduced at the C-terminus of d-isoglutamine to help the molecules access cytoplasmic NOD2 receptors and activate the innate immune system. Lipophilic MDP congeners are thus obtained by adopting a direct or indirect convergent synthetic route with overall yields of >50%. We found that an indirect approach can reliably be implemented on gram scale, thereby unlocking access to substantial amounts of pathogen-associated molecular patterns for in vivo studies, which will accelerate the development of NOD2 immuno-adjuvants against viral and bacterial infections.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,206
Écart entre enseignants0,196 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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