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Enregistrement W4313354637 · doi:10.4049/jimmunol.190.supp.50.41

Epigenetic licensing of Th17 and Treg cell differentiation (P1197)

2013· article· en· W4313354637 sur OpenAlexaff
Frann Antignano, Kyle Burrows, Michael R. Hughes, Menno J. Oudhoff, Jonathan Han, Matthew Gold, Kelly M. McNagny, Megan K. Levings, Colby Zaph

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Immunology · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmunodeficiency and Autoimmune Disorders
Établissements canadiensChild and Family Research InstituteArthritis Research Centre of CanadaUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésHistone H3FOXP3Chromatin immunoprecipitationCell biologyEpigeneticsCellular differentiationHistoneBiologyHistone methyltransferaseChromatinT cellChemistryImmunologyPromoterGene expressionImmune systemGeneBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Naïve CD4+ T helper (Th) cells acquire a range of fates depending on the cytokine milieu and anatomical location. For example, IL-17 producing Th17 and Foxp3+ regulatory (Treg) cells are dependent upon TGFβ1 and are critical for intestinal homeostasis. G9a is a histone lysine methyltransferase with di-methyl activity towards histone H3 lysine 9. H3K9me2 is a highly conserved histone modification and is commonly linked to transcriptional repression. In this study we examine the role of G9a in the control of Th17 and Treg cell differentiation. Using chromatin immunoprecipitation (ChIP) we found that there is a concomitant loss H3K9me2 and increase in H3K9Ac (an activating histone modification) at lineage specific genes of WT Th17 and Treg cells compared to naive. Meanwhile, naïve G9a-/- T cells have low levels H3K9me2 that results in enhanced sensitivity to TGFβ1 and an increase in the differentiation of both Th17 and Treg cells in vitro. Using the T cell transfer colitis model, we found that transfer of G9a-deficient T cells fails to cause the weight loss and colonic inflammation typical of the model. Furthermore, T effector-cell production of IFNγ was significantly reduced and IL-17 was enhanced when G9a-/- T cells were transferred. In addition, compared to WT controls, a higher proportion of G9a-deficient T cells express Foxp3. We conclude that G9a-dependent H3K9me2 is a homeostatic epigenetic checkpoint that controls the magnitude of Th17 and Treg cell responses.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,019

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0060,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,187
Écart entre enseignants0,182 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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