Differential phenotypes and localization of CD8 T cell responses to acute and chronic viral infections
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Norovirus is the most common viral cause of gastroenteritis globally. Most infections are either acute, symptomatic, and rapidly cleared or persist asymptomatically. However, the mechanisms underlying these outcomes are unknown. MNV-CW3 and -CR6 are murine noroviruses which demonstrate immune correlates of acute and chronic infection respectively. This research interrogates the mechanisms underlying strain-specific differential antiviral CD8 T cell responses to acute or chronic MNV. At days 3, 4, 5 and 8 post-infection, the phenotype and quantity of adoptively transferred MNV specific CD8 T cells in the spleen, mesenteric lymph node (MLN), and intestines are analyzed by flow cytometry. Concurrently, fluorescent microscopy is used to determine the biogeographical distribution of antiviral CD8 T cells throughout the intestine. Flow cytometry shows activated MNV-specific CD8 T cells first accumulate in the MLN following oral infection with either virus suggesting this is the site of immune activation though CR6 infection results in a delayed, reduced CD8 T cell response as shown by CFSE dilution. Supporting the MLN as a primary initiation site of the antiviral CD8 T cell response, prevention of T cell egress from activation sites by FTY720 treatment enriches activated CD8 T cells in the MLN in CW3 infections with a concurrent decrease in the spleen. Furthermore, by day 8 post-infection CD8 T cell populations are skewed to memory precursors or short-lived effectors in CW3 and CR6, respectively. These data suggest these highly related viral strains may induce activation of distinct populations of, or pathways in, APC populations with long-lasting effects on CD8 T cell function and the outcome of infection.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».