A robust human immunophenotyping workflow using CyTOF technology coupled with Maxpar Pathsetter, an automated data analysis software
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Mass cytometry, which utilizes CyTOF® technology, is a single-cell analysis platform that uses metal-tagged antibodies. An advantage of CyTOF is its ability to resolve more than 40 parameters in a single panel without the need for compensation, making mass cytometry an ideal solution for routine enumeration of immune cells. Developing a robust and highly multiplexed assay requires an optimized panel and analysis pipeline, and the analysis of complex panels is time-consuming and difficult to interpret without expertise in immunology. The Maxpar® Direct Immune Profiling Assay™ coupled with Maxpar Pathsetter™ software is a sample-to-answer solution for human immune profiling using mass cytometry. The Maxpar Direct Immune Profiling Assay kit includes an optimized 30-marker panel contained in a lyophilized single-tube format, protocols for human whole blood and PBMC staining, and data acquisition instructions on a Helios™ system. Maxpar Pathsetter is an automated software that accepts FCS 3.0 files and reports cell counts, percentage calculations, and staining intensity. It also produces graphical elements such as histograms, dot plots, and a Cen-se’™ (t-SNE variant) graph for 36 immune cell populations. We present analytical validation data on repeatability and reproducibility for the assay and on the precision and accuracy of Maxpar Pathsetter software. We demonstrate comparative performance between the lyophilized panel and a liquid panel of the same antibodies. Coupling Maxpar Pathsetter software with the Maxpar Direct Immune Profiling Assay reduces variability in sample preparation and subjectivity in data analysis. It allows researchers to have a streamlined solution for broad immune profiling using mass cytometry.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».