Autoimmune variant PTPN22 is associated with impaired responses to influenza virus vaccination
Notice bibliographique
Résumé
Abstract High-affinity antibody production, T cell activation, and Interferon upregulation all contribute to protective immunity that occurs in humans following influenza immunization. Hematopoietic cell-specific PTPN22 encodes Lymphoid Phosphatase (Lyp), which regulates lymphocyte antigen receptor and Pattern Recognition Receptor (PRR) signaling. A PTPN22 variant R620W (LypW) predisposes to autoimmune and infectious disease, and confers altered signaling through antigen receptors and PRRs. We tested the hypothesis that LypW-bearing humans would have diminished immune response to trivalent influenza vaccine (TIV). LypW carriers exhibited decreased induction of influenza-specific CD4 T cells expressing effector cytokines, and failed to increase antibody affinity following TIV. No differences between LypW carriers and non-carriers were observed in virus-specific CD8 T cell responses, early interferon transcriptional responses, or myeloid APC costimulatory molecule upregulation. LypW association with defects in TIV-induced CD4 T cell expansion and antibody affinity maturation suggests that LypW may predispose to diminished capacity to generate protective immunity against influenza.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».