Gene expression profile of allergen-experienced group 2 innate lymphoid cells (HYP2P.323)
Notice bibliographique
Résumé
Abstract We previously identified group 2 innate lymphoid cells (ILC2s) in mouse lungs. Upon allergen encounter, they produce type 2 cytokines and mediate T cell-independent allergic lung inflammation and also promote Th2 responses. We have recently found that allergen-treatments of mice result in significant increase in the number of ILC2s in the lung and lymph node even after the resolution of inflammation for several weeks. The allergen-experienced ILC2s are more responsive to unrelated allergens than naive ILC2s and rapidly induce allergic lung inflammation. To characterize the allergen-experienced ILC2s, we have performed microarray analysis of ILC2s purified from naïve mice and allergen-treated mice 4 days, 2 weeks, and 4 months after the treatment. The genes that are differentially expressed at different time points include those encoding chemokines, cytokines and their receptors, cell cycle and proliferation related proteins, adhesion molecules, and transcription factors. Gene Set Enrichment Analyses of the ILC2 populations revealed that allergen-experienced ILC2s are enriched for the gene signature of memory T cells. These results suggest that activated ILC2s undergo cell intrinsic changes and acquire memory-like features that are governed by the same set of genes as those responsible for memory T cell differentiation.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».