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Enregistrement W4313386330 · doi:10.4049/jimmunol.190.supp.118.21

Identification of human endogenous retrovirus (HERV-K(HML-2))-specific mucosal CD4+ T cell responses in HIV-1-exposed, seronegative individuals (P6195)

2013· article· en· W4313386330 sur OpenAlexaff
Devi SenGupta, Susan Pereira Ribeiro, Henri-Alexandre Michaud, Liyen Loh, Ravi Tandon, R. Jones, Keith Garrison, Vanessa A. York, Edécio Cunha‐Neto, Mario Ostrowski, Christopher D. Pilcher, Frederick Hecht, Jean Martin, Steven G. Deeks, Peter Hunt, Douglas F. Nixon

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Immunology · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueChromosomal and Genetic Variations
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésImmunologyCD8BiologyAntigenPeripheral blood mononuclear cellT cellFlow cytometryImmunityVirologyImmune systemIn vitroGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The transcriptional silence of human endogenous retroviruses (HERV) can be disrupted in HIV-1 infection. We have reported that the strength of the HERV-specific CD8+ T cell response predicts lower HIV-1 viral load in untreated adults. To determine whether HERV-K immunity plays a role in inhibiting HIV-1 replication at a major site of transmission and CD4+ T cell depletion, we assessed these responses in gut-associated lymphoid tissue (GALT) from rectosigmoid biopsies and blood of HIV-1 exposed, seronegative (HESN) individuals (n=6) by flow cytometry. CMV pp65- and HIV-1 Gag-specific T cells were also measured, and all responses were compared with peripheral antigen-specific responses in uninfected, low-risk controls (n=11). With the exception of stronger CMV-specific CD8+ T cell responses in the HESN group (p=0.024), there were no significant differences between the magnitudes of peripheral antigen-specific T cell responses in the HESN vs. controls. However, HESN subjects had remarkably robust mucosal HIV-1- (median %CD4+cytokine+cells=2.67) and HERV-specific (median %CD4+cytokine+cells=3.41) CD4+ responses, which were much stronger than the corresponding PBMC responses (p=0.0079 and p<0.0001, respectively). These findings suggest that the GALT is an important site of HERV-K expression and immunity in individuals exposed to HIV-1, and should be further investigated in the context of novel vaccine strategies that target conserved antigens such as HERV.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,033
Tête enseignante GPT0,228
Écart entre enseignants0,195 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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