DPYD Exon 4 Deletion Associated with Fluoropyrimidine Toxicity and Importance of Copy Number Variation
Notice bibliographique
Résumé
Fluoropyrimidine chemotherapy is associated with interpatient variability in toxicity. A major contributor to unpredictable and severe toxicity relates to single nucleotide variation (SNV) in dihydropyrimidine dehydrogenase (DPYD), the rate-limiting fluoropyrimidine metabolizing enzyme. In addition to SNVs, a study of Finnish patients suggested that a DPYD exon 4 deletion was observed in their population. To better understand the potential generalizability of such findings, we investigated the presence of this exon 4 deletion in our Canadian patient population, using a TaqMan assay. We selected 125 patients who experienced severe fluoropyrimidine-associated toxicity, and 125 matched controls. One patient in the severe toxicity group harbored a haploid DPYD exon 4 deletion, and required a 35% dose reduction after their first fluoropyrimidine treatment cycle due to toxicity and required an additional 30% dose reduction before tolerating treatment. The predicted allele frequency was 0.2% in our cohort, much lower than the 2.4% previously reported. We also carried out a literature review of copy number variation (CNV) in the DPYD gene, beyond fluoropyrimidine toxicity and show that various types of CNV in DPYD are present in the population. Taken together, our findings suggest that CNV in DPYD may be an underappreciated determinant of DPYD-mediated fluoropyrimidine toxicity.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,002 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».