Impact of the HLA Immunopeptidome on Survival of Leukemia Patients After Unrelated Donor Transplantation
Notice bibliographique
Résumé
PURPOSE Immunopeptidome divergence between mismatched HLA-DP is a determinant of T-cell alloreactivity and clinical tolerability after fully HLA-A, -B, -C, -DRB1, -DQB1 matched unrelated donor hematopoietic cell transplantation (UD-HCT). Here, we tested this concept in HLA-A, -B, and -C disparities after single class I HLA-mismatched UD-HCT. PATIENTS AND METHODS We studied 2,391 single class I HLA-mismatched and 14,426 fully HLA-matched UD-HCT performed between 2008 and 2018 for acute leukemia or myelodysplastic syndromes. Hierarchical clustering of experimentally determined peptide-binding motifs (PBM) was used as a proxy for immunopeptidome divergence of HLA-A, -B, or -C disparities, allowing us to classify 1,629/2,391 (68.1%) of the HLA-mismatched UD-HCT as PBM-matched or PBM-mismatched. Risks associated with PBM-matching status were assessed by Cox proportional hazards models, with overall survival (OS) as the primary end point. RESULTS Relative to full matches, bidirectional or unidirectional PBM mismatches in graft-versus-host (GVH) direction (PBM-GVH mismatches, 60.7%) were associated with significantly lower OS (hazard ratio [HR], 1.48; P < .0001), while unidirectional PBM mismatches in host-versus-graft direction or PBM matches (PBM-GVH matches, 39.3%) were not (HR, 1.13; P = .1017). PBM-GVH mismatches also had significantly lower OS than PBM-GVH matches in direct comparison (HR, 1.32; P = .0036). The hazards for transplant-related mortality and acute and chronic graft-versus-host disease but not relapse increased stepwise from full HLA matches to single PBM-GVH matches, and single PBM-GVH mismatches. A webtool for PBM-matching of single class I HLA-mismatched donor-recipient pairs was developed. CONCLUSION PBM-GVH mismatches inform mortality risks after single class I HLA-mismatched UD-HCT, suggesting that prospective consideration of directional PBM-matching status might improve outcome. These findings highlight immunopeptidome divergence between mismatched HLA as a driver of clinical tolerability in UD-HCT.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».