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Enregistrement W4317951846 · doi:10.1038/s41586-022-05546-8

Questioning the fetal microbiome illustrates pitfalls of low-biomass microbial studies

2023· review· en· W4317951846 sur OpenAlexafffund
Katherine M. Kennedy, Marcus C. de Goffau, María Elisa Pérez-Muñoz, Marie‐Claire Arrieta, Fredrik Bäckhed, Peer Bork, Thorsten Braun, Frederic D. Bushman, Joël Doré, Willem M. de Vos, Ashlee M. Earl, Jonathan A. Eisen, Michal A. Elovitz, Stephanie C. Ganal‐Vonarburg, Michael G. Gänzle, Wendy S. Garrett, Lindsay J. Hall, Mathias W. Hornef, Curtis Huttenhower, Liza Konnikova, Sarah Lebeer, Andrew J. Macpherson, Ruth C. Massey, Alice C. McHardy, Omry Koren, Trevor D. Lawley, Ruth E. Ley, Liam O’Mahony, Paul W. O’Toole, Eric G. Pamer, Julian Parkhill, Jeroen Raes, Thomas Rattei, Anne Salonen, Eran Segal, Nicola Segata, Fergus Shanahan, Deborah M. Sloboda, Gordon C. S. Smith, Harry Sokol, Tim D. Spector, Michael G. Surette, Gerald W. Tannock, Alan W. Walker, Moran Yassour, Jens Walter

Notice bibliographique

RevueNature · 2023
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGut microbiota and health
Établissements canadiensUniversity of CalgaryUniversity of AlbertaMcMaster UniversityPopulation Health Research Institute
Organismes subventionnairesNational Heart, Lung, and Blood InstituteBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesMedical Research CouncilHorizon 2020 Framework ProgrammeBijzonder Onderzoeksfonds UGentDirectorate for Biological SciencesNational Institutes of HealthU.S. Department of Health and Human ServicesCanada Research ChairsDeutsche ForschungsgemeinschaftKU LeuvenNational Institute of Nursing ResearchNational Institute for Health and Care ResearchVlaamse regeringEunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human DevelopmentNIHR Cambridge Biomedical Research CentreEuropean CommissionBroad InstituteWellcome TrustNational Cancer InstituteRural and Environment Science and Analytical Services DivisionScience Foundation Ireland
Mots-clésMicrobiomeHuman Microbiome ProjectBiologyMetagenomicsFetusMicrobial ecologyHuman microbiomePhysiologyEcologyEvolutionary biologyComputational biologyPregnancyBioinformaticsGeneticsBacteriaGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex
Aucun résumé dans les sources couvertes. Son absence est consignée, pas traitée comme un négatif.

Aucun résumé. Ce n'est pas une lacune de cette base de données : OpenAlex n'en a pas non plus. 23,3 % de la base est dans cet état, et le tri y repère MOITIÉ moins de métarecherche ; l'absence est donc un biais mesuré, et non un champ manquant.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Intégrité de la recherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,769
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0030,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,036
Tête enseignante GPT0,376
Écart entre enseignants0,340 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations362
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentnon

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