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Enregistrement W4318570212 · doi:10.1016/j.cmpbup.2023.100096

Semi-supervised active transfer learning for fetal ECG arrhythmia detection

2023· article· en· W4318570212 sur OpenAlexafffund
Mohammad Reza Mohebbian, Hamid Reza Marateb, Khan A. Wahid

Notice bibliographique

RevueComputer Methods and Programs in Biomedicine Update · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueECG Monitoring and Analysis
Établissements canadiensUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésAutoencoderTransfer of learningArtificial intelligenceComputer scienceAnomaly detectionPattern recognition (psychology)Deep learningCalibrationMachine learningStatisticsMathematics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Deep learning has demonstrated excellent results for ECG anomaly detection, wherein most approaches used supervised learning. The requirement of thousands of manually annotated samples is a concern for state-of-the-art anomaly detection systems, especially for fetal ECG (FECG), and currently, there is not a publicly available FECG dataset annotated for each FECG beat. In this paper, we offer a modified active learning technique based on transfer learning, calibration probability, and autoencoder-based sampling to reduce number of samples requires to annotate. In this regard, we used 25,000 s of recording from 47 patients from the MIT-BIH Arrhythmia Database to train a deep learning model to detect anomalies in non-fetus subjects. Then we used the unlabeled Non-Invasive Fetal ECG Arrhythmia Database (NIFEA DB) of 26 subjects to fine-tune the trained model to fine-tune the trained model based on active learning to detect anomalies in binary form for fetal. A variational autoencoder is trained on all data (adult and fetal ECG), and clustering is applied to latent features extracted from data after dimension reduction. Then, the sampling process of active learning selected samples from different clusters with low confidence to cover all data distribution. Moreover, a probability calibration based on mc-dropout and isotonic regression is used to calibrate confidences, helping to select reliable low-confidence samples. Various ablation studies were performed to show the influence of autoencoder-based sampling, calibration, and transfer learning, which showed that the proposed method could achieve 92% accuracy using 399 training samples. In contrast, other methods required more training samples to reach the same level of accuracy without calibration or an autoencoder and clustering approach or training without active learning. The study also found that transfer learning significantly impacted faster convergence and that the proposed active learning approach was more effective than traditional methods.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,051
Tête enseignante GPT0,368
Écart entre enseignants0,316 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations30
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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