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Enregistrement W4318916622 · doi:10.1242/jcs.260496

Re-organization of nucleolar architecture in myogenic differentiation

2023· article· en· W4318916622 sur OpenAlexafffund
Tetsuaki Miyake, John C. McDermott

Notice bibliographique

RevueJournal of Cell Science · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA modifications and cancer
Établissements canadiensYork University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health ResearchYork University
Mots-clésMyogenesisNucleolusBiologyRibosome biogenesisCell biologyMultinucleateMyocyteTranscriptomeCellular differentiationNucleolus organizer regionPI3K/AKT/mTOR pathwayRibosomeGene expressionSignal transductionGeneticsGeneRNANucleus

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Myogenesis, the process of muscle differentiation, requires an extensive remodeling of the cellular transcriptome and proteome. Whereas the transcriptional program underpinning myogenesis is well characterized, the required adaptation in protein synthesis is incompletely understood. Enhanced protein synthesis necessitates ribosome biogenesis at the nucleolus. Nucleolar size and activity are inextricably linked with altered gene expression. Here, we report changes in nucleolar morphology and function during myogenic differentiation. Immunofluorescence analysis revealed alterations in nucleolar morphology that were dependent on the cellular state - proliferative or quiescent myogenic progenitors (myoblasts or reserve cells) contained multiple small nucleoli with a characteristic spherical shape, whereas multinucleated myotubes typically contained one large, often irregularly shaped nucleolus. These morphological alterations are consistent with changes to nucleolar phase separation properties. Re-organization of the nucleolar structure was correlated with enhanced rRNA production and protein translation. Inhibition of mTOR signaling with rapamycin perturbed nucleolar re-organization. Conversely, hyperactivated mTOR enhanced alterations in nucleolar morphology. These findings support the idea that there is an mTOR dependent re-organization of nucleolar structure during myogenesis, enhancing our understanding of myogenesis and possibly facilitating new approaches to therapeutic interventions in muscle pathologies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,133
Score d'incertitude au seuil0,104

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,236
Écart entre enseignants0,229 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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