MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4319294334 · doi:10.1371/journal.ppat.1011135

Phenotypic effects of mutations observed in the neuraminidase of human origin H5N1 influenza A viruses

2023· article· en· W4319294334 sur OpenAlexaff
David Scheibner, Ahmed H. Salaheldin, Ola Bagato, Luca M. Zaeck, Ahmed Mostafa, Ulrike Blohm, Christin Müller, Ahmad F. Eweas, Kati Franzke, Axel Karger, Alexander Schäfer, Marcel Gischke, Donata Hoffmann, Solène Lerolle, Xuguang Li, Hatem S. Abd El-Hamid, Jutta Veits, Angele Breithaupt, Geert‐Jan Boons, Mikhail Matrosovich, Stefan Finke, Stephan Pleschka, Thomas C. Mettenleiter, Robert P. de Vries

Notice bibliographique

RevuePLoS Pathogens · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueInfluenza Virus Research Studies
Établissements canadiensUniversity of OttawaHealth Canada
Organismes subventionnairesEuropean Social FundHorizon 2020Nederlandse Organisatie voor Toegepast Natuurwetenschappelijk OnderzoekNational Research CentreDeutsche ForschungsgemeinschaftEuropean CommissionDeutsches Zentrum für InfektionsforschungNederlandse Organisatie voor Wetenschappelijk Onderzoek
Mots-clésInfluenza A virus subtype H5N1BiologyVirologyNeuraminidaseViral replicationVirulenceVirusInfluenza A virusH5N1 genetic structureGeneGeneticsCoronavirus disease 2019 (COVID-19)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Global spread and regional endemicity of H5Nx Goose/Guangdong avian influenza viruses (AIV) pose a continuous threat for poultry production and zoonotic, potentially pre-pandemic, transmission to humans. Little is known about the role of mutations in the viral neuraminidase (NA) that accompanied bird-to-human transmission to support AIV infection of mammals. Here, after detailed analysis of the NA sequence of human H5N1 viruses, we studied the role of A46D, L204M, S319F and S430G mutations in virus fitness in vitro and in vivo. Although H5N1 AIV carrying avian- or human-like NAs had similar replication efficiency in avian cells, human-like NA enhanced virus replication in human airway epithelia. The L204M substitution consistently reduced NA activity of H5N1 and nine other influenza viruses carrying NA of groups 1 and 2, indicating a universal effect. Compared to the avian ancestor, human-like H5N1 virus has less NA incorporated in the virion, reduced levels of viral NA RNA replication and NA expression. We also demonstrate increased accumulation of NA at the plasma membrane, reduced virus release and enhanced cell-to-cell spread. Furthermore, NA mutations increased virus binding to human-type receptors. While not affecting high virulence of H5N1 in chickens, the studied NA mutations modulated virulence and replication of H5N1 AIV in mice and to a lesser extent in ferrets. Together, mutations in the NA of human H5N1 viruses play different roles in infection of mammals without affecting virulence or transmission in chickens. These results are important to understand the genetic determinants for replication of AIV in mammals and should assist in the prediction of AIV with zoonotic potential.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,686
Score d'incertitude au seuil0,445

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,228
Tête enseignante GPT0,410
Écart entre enseignants0,182 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations36
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuePLoS PathogensMême sujetInfluenza Virus Research StudiesTravaux en français237 207