ATG16L1 deficiency exacerbates acute small intestinal epithelial damage.
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Polymorphisms of the autophagy-related gene ATG16L1 are known to contribute to the genetic risk for developing Crohn’s Disease (CD), an inflammatory bowel disease that can affect the entire gastrointestinal tract. Previous studies have shown a role for autophagy in the intestinal epithelium both in Paneth cell function and in protection from intestinal damage, but no spontaneous disease at baseline. Here, we challenged mice specifically deleted for Atg16l1 in intestinal epithelial cells (Atg16l1ΔIEC) with the anti-CD3 mediated model of acute small intestinal injury. Rapid T cell activation by anti-CD3 injection results in small intestinal damage within 24 hours of injection, this typically self-resolves in wild-type mice 5 days post treatment. We found that autophagy sufficiency was protective in anti-CD3 induced injury. Atg16l1ΔIEC mice had higher mortality and worsened pathology in comparison to their wild-type littermates. We found indications of increased intestinal barrier permeability and crypt cell apoptosis in Atg16l1ΔIEC mice. In addition, expression of interferon gamma (IFNγ) and tumour necrosis factor (TNF) was significantly increased in Atg16l1ΔIEC mice, cytokines that have been implicated in driving intestinal injury in autophagy-deficient mice. Antibody-mediated blockade of either TNF or IFNγ rescued survival of Atg16l1ΔIEC mice. Interestingly, anti-IFNγ abolished both the crypt cell apoptosis and Paneth cell death at 24 hours, whereas anti-TNF did not decrease the crypt cell apoptosis or Paneth cell death, suggesting IFNγ is the primary contributor to pathology in this model. Overall, this work implicates intestinal epithelial autophagy in the protective response to acute intestinal injury.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».