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Enregistrement W4319764005 · doi:10.3390/molecules28041634

Peptidic Inhibitors and a Fluorescent Probe for the Selective Inhibition and Labelling of Factor XIIIa Transglutaminase

2023· article· en· W4319764005 sur OpenAlexafffund
Eric W. J. Gates, Kian Mansour, Sahar Ebrahimi Samani, Sammir Shad, Mari T. Kaartinen, Jeffrey W. Keillor

Notice bibliographique

RevueMolecules · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueBlood properties and coagulation
Établissements canadiensMcGill UniversityUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésFactor XIIIaTissue transglutaminaseChemistryBiochemistryProteasesLinkerLabellingFluorescenceBiophysicsCombinatorial chemistryEnzymeBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Factor XIIIa (FXIIIa) is a transglutaminase of major therapeutic interest for the development of anticoagulants due to its essential role in the blood coagulation cascade. While numerous FXIIIa inhibitors have been reported, they failed to reach clinical evaluation due to their lack of metabolic stability and low selectivity over transglutaminase 2 (TG2). Furthermore, the chemical tools available for the study of FXIIIa activity and localization are extremely limited. To combat these shortcomings, we designed, synthesised, and evaluated a library of 21 novel FXIIIa inhibitors. Electrophilic warheads, linker lengths, and hydrophobic units were varied on small molecule and peptidic scaffolds to optimize isozyme selectivity and potency. A previously reported FXIIIa inhibitor was then adapted for the design of a probe bearing a rhodamine B moiety, producing the innovative KM93 as the first known fluorescent probe designed to selectively label active FXIIIa with high efficiency (kinact/KI = 127,300 M−1 min−1) and 6.5-fold selectivity over TG2. The probe KM93 facilitated fluorescent microscopy studies within bone marrow macrophages, labelling FXIIIa with high efficiency and selectivity in cell culture. The structure–activity trends with these novel inhibitors and probes will help in the future study of the activity, inhibition, and localization of FXIIIa.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,090
Score d'incertitude au seuil0,179

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,250
Écart entre enseignants0,228 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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