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Notice bibliographique
Résumé
Aurodox is a specialised metabolite of Streptomyces goldiniensis originally identified for its anti-streptococcal and anti-staphylococcal activity. More recently, there has been a renewed focus on the study of aurodox as the compound has been shown to inhibit virulence in both Enteropathogenic and Enterohemorrhagic Escherichia coli (EPEC/EHEC). Aurodox is able to inhibit host colonization in EPEC and EHEC infections via the downregulation of the Type III Secretion System – a major virulence factor in these pathogens. To further investigate activity, increased quantities of the compound are required for in-depth mechanism of action studies. To identify suitable aurodox production conditions, a number of relevant fermentation media were tested for enhanced aurodox yield, followed by bioassay and Liquid Chromatography Mass Spectrometry analysis. Glucose Yeast Extract medium (GYM) was identified as the leading production medium tested. Further analysis of S. goldiniensis growth in GYM medium established the optimum temporal range for aurodox production. A minimum growth period of 154 hours is required for detectable aurodox production in S. goldiniensis fermentations in liquid GYM medium. To improve overall aurodox titres, a heterologous expression (HE) approach was taken and four potential HE hosts were investigated. These data indicated that the aurodox biosynthetic gene cluster can be heterologously expressed in both S. collinus Tü365 and S. coelicolor M1152, with increased aurodox titres compared to those of S. goldiniensis. This work demonstrates how traditional physiological analysis and modern genetic techniques can be combined to improve natural product production for detailed mode-of-action studies.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,018 | 0,204 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,003 | 0,003 |
| Bibliométrie | 0,005 | 0,003 |
| Études des sciences et des technologies | 0,003 | 0,002 |
| Communication savante | 0,010 | 0,007 |
| Science ouverte | 0,005 | 0,006 |
| Intégrité de la recherche | 0,008 | 0,009 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,642 | 0,315 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; l’étiquette directe de Gemma et le classifieur distillé Codex s’accordent sur ce qui est montré ici.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».