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Enregistrement W4319983305 · doi:10.5376/pgt.2023.14.0001

Cloning and Expression Analysis of <i>PeDIR19</i> Gene in Poplar

2023· article· en· W4319983305 sur OpenAlexvenueno aff
Lingling Li, Yuan Wang, Peijun Zhou, Xuefei Yang, Wenwen Tan, Weibo Sun, Qiang Zhuge

Notice bibliographique

RevuePlant Gene and Trait · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBiochemical and biochemical processes
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Natural Science Foundation of ChinaNanjing Forestry University
Mots-clésMethyl jasmonateAbscisic acidGeneGene expressionBotanySalicylic acidBiologyChemistryBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Dirigent ( DIR ) gene plays an important role in the formation of lignin and lignans by controlling the stereoselective coupling of pineperin alcohol monomers in plants during the polymerization of lignin and lignans. In this study, we take the ‘Nanlin 895’ ( Populus deltoides × P. euramericana  cv ‘Nanlin 895’) as the material, and clone the PeDIR19  gene. PeDIR19 , the whole length of 588 bp, has a length of 555 bp in ORF region and has only a length of 33 bp intron in the middle. PeDIR19 protein codes 185 amino acids and is a hydrophobic protein. It has four conservative motifs and has a highly conservative structural functional domain between 50 bp ~ 142 bp. PeDIR19  gene was found to have the highest homology with Populus trichocarpa   PtDIR19 ( Potri.001G009100 ), with only four bases differences. By phylogenetic analysis, PeDIR19  gene belongs to DIR -B/D subfamily. Through tissue specific expression analysis of ‘Nanlin 895’ with different growth stages, it was found that PeDIR19  gene expression level was the highest in the root during the tissue culture seedlings and in the stem during the pot seedlings. PeDIR19  gene had a strong response after 1 d under the induction of Yangpan Erbaojun ( Marssonina brunnea ). Under the induction of salicylic acid, methyl jasmonate and abscisic acid stress, PeDIR19  gene can strongly respond to the stress of methyl jasmonate and abscisic acid and weakly respond to the salicylic acid stress. This study provides a solid foundation for further study on the function identification of DIR  gene in the biosynthetic pathway of plant resistance.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,008
Score d'incertitude au seuil0,507

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,220
Écart entre enseignants0,210 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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