MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4319983800 · doi:10.1186/s13075-023-02997-w

Interferon and interferon-induced cytokines as markers of impending clinical progression in ANA+ individuals without a systemic autoimmune rheumatic disease diagnosis

2023· article· en· W4319983800 sur OpenAlexafffund
Sonya T. Kim, Carolina Muñoz‐Grajales, Shannon E. Dunn, Raphaël Schneider, Sindhu R. Johnson, Zahi Touma, Zareen Ahmad, Dennisse Bonilla, Eshetu G. Atenafu, Linda T. Hiraki, Arthur Bookman, Joan Wither

Notice bibliographique

RevueArthritis Research & Therapy · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSystemic Lupus Erythematosus Research
Établissements canadiensHospital for Sick ChildrenPrincess Margaret Cancer CentreToronto Western HospitalArthritis SocietyMount Sinai HospitalSt. Michael's HospitalSickKids FoundationUniversity of TorontoUniversity Health Network
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchArthritis SocietyPfizer
Mots-clésMedicineRheumatologyAsymptomaticImmunologyInterferonAntibodyBiomarkerInternal medicineDiseaseCytokineBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background Elevated levels of interferons (IFNs) are a characteristic feature of systemic autoimmune rheumatic diseases (SARDs) and may be useful in predicting impending symptomatic progression in anti-nuclear antibody-positive (ANA + ) individuals lacking a SARD diagnosis. Typically, these are measured by their effect on gene expression in the blood, which has limited their utility in clinical settings. Here, we assessed whether the measurement of serum IFN-α or selected IFN-induced cytokines accurately mirrors IFN-induced gene expression in ANA + individuals and investigated their utility as biomarkers of clinical progression. Methods A total of 280 subjects were studied, including 50 ANA − healthy controls, 160 ANA + individuals without a SARD diagnosis (96 asymptomatic, 64 with undifferentiated connective tissue disease), and 70 SARD patients. IFN-induced gene expression was measured by nanoString and cytokine levels by ELISA or Simoa. ANA + individuals lacking a SARD diagnosis who had the new onset of SARD criteria over the subsequent 2 years were defined as progressors. Results Measurement of IFN-α levels by high-sensitivity ELISA or Simoa correlated much better with IFN-induced gene expression than measurement of CXCL-10 or Galectin-9 levels. Despite this, high CXCL-10 and Galectin-9 levels were better predictors of subsequent progression in ANA + individuals than measures of IFN-α or IFN-induced gene expression with the optimal combination of predictive cytokines (CXCL-10 and IFN-α as measured by ELISA), resulting in a specificity and positive predictive value of 100%. Conclusion Easily performed ELISA assays for CXCL-10 and IFN-α can be used to predict ANA + individuals at high risk of imminent symptomatic progression.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,007
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,128
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0070,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,101
Tête enseignante GPT0,445
Écart entre enseignants0,344 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueArthritis Research & TherapyMême sujetSystemic Lupus Erythematosus ResearchTravaux en français237 207