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Enregistrement W4320486061 · doi:10.26508/lsa.202201810

Dual function of Rab1A in secretion and autophagy: hypervariable domain dependence

2023· article· en· W4320486061 sur OpenAlexfundno aff
Valeriya Gyurkovska, Rakhilya Murtazina, Sarah F. Zhao, Sojin Shikano, Yukari Okamoto, Nava Segev

Notice bibliographique

RevueLife Science Alliance · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCellular transport and secretion
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of Neurological Disorders and StrokeNational Institute of General Medical SciencesNational Institutes of HealthUniversity of Alberta
Mots-clésAutophagyRabCell biologySecretionGTPaseEndocytosisBiologyIntracellularChemistryReceptorApoptosisBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We currently understand how the different intracellular pathways, secretion, endocytosis, and autophagy are regulated by small GTPases. In contrast, it is unclear how these pathways are coordinated to ensure efficient cellular response to stress. Rab GTPases localize to specific organelles through their hypervariable domain (HVD) to regulate discrete steps of individual pathways. Here, we explored the dual role of Rab1A/B (92% identity) in secretion and autophagy. We show that although either Rab1A or Rab1B is required for secretion, Rab1A, but not Rab1B, localizes to autophagosomes and is required early in stress-induced autophagy. Moreover, replacing the HVD of Rab1B with that of Rab1A enables Rab1B to localize to autophagosomes and regulate autophagy. Therefore, Rab1A-HVD is required for the dual functionality of a single Rab in two different pathways: secretion and autophagy. In addition to this mechanistic insight, these findings are relevant to human health because both the pathways and Rab1A/B were implicated in diseases ranging from cancer to neurodegeneration.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,698
Score d'incertitude au seuil0,292

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,235
Écart entre enseignants0,223 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations26
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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