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Enregistrement W4320881663 · doi:10.1101/2023.02.15.528626

High-resolution assessment of multidimensional cellular mechanics using label-free refractive-index traction force microscopy

2023· preprint· en· W4320881663 sur OpenAlexaff
Moosung Lee, Hyuntae Jeong, Chaeyeon Lee, Mahn Jae Lee, Benedict Reve Delmo, Won Do Heo, Jennifer H. Shin, YongKeun Park

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2023
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCellular Mechanics and Interactions
Établissements canadiensKootenay Association for Science & Technology
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésTraction (geology)MicroscopyMaterials sciencePlanarFluorescence recovery after photobleachingTractive forceBiological systemBiomedical engineeringOpticsPhysicsFluorescenceComputer science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT A critical requirement for studying cell mechanics is three-dimensional (3D) assessment of cellular shapes and forces with high spatiotemporal resolution. Traction force microscopy (TFM) with fluorescence imaging enables the measurement of cellular forces, but it is limited by photobleaching and a slow 3D acquisition speed. Here, we present refractive-index traction force microscopy (RI-TFM), a high-speed volumetric technique that simultaneously quantifies the 3D morphology and traction force of cells. RI-TFM reconstructs a 3D tomogram of single cells on a planar hydrogel elastomer using a high-speed illumination scheme with 0.5-Hz temporal resolution. This allows for quantitative analyses of 3D dry-mass distributions and shear (in-plane) and normal (out-of-plane) tractions of single cells on the extracellular matrix without labelling. When combined with a constrained total variation-based deconvolution algorithm, the proposed method provides 0.55-Pa shear (in-plane) and 1.59-Pa normal (out-of-plane) traction sensitivity for a 1-kPa hydrogel substrate. We demonstrate the utility of RI-TFM by assessing the effects of compromised intracellular stress due to actin disruption or low temperature and capturing the rapid dynamics of cellular junction formation in the spatiotemporal changes in non-planar traction components.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,272
Écart entre enseignants0,252 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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