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Enregistrement W4320913736 · doi:10.1063/5.0105843

Network topologies for maximal organismal health span and lifespan

2023· article· en· W4320913736 sur OpenAlexafffund
Garrett Stubbings, Andrew D. Rutenberg

Notice bibliographique

RevueChaos An Interdisciplinary Journal of Nonlinear Science · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetics, Aging, and Longevity in Model Organisms
Établissements canadiensDalhousie University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésNetwork topologyBiological networkLongevityComplex networkComputer scienceParametric statisticsScale-free networkScale (ratio)Life spanSpan (engineering)Topology (electrical circuits)BiologyMathematicsEvolutionary biologyComputer networkBioinformaticsEngineeringStatisticsGeneticsPhysics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The population dynamics of human health and mortality can be jointly captured by complex network models using scale-free network topology. To validate and understand the choice of scale-free networks, we investigate which network topologies maximize either lifespan or health span. Using the Generic Network Model (GNM) of organismal aging, we find that both health span and lifespan are maximized with a "star" motif. Furthermore, these optimized topologies exhibit maximal lifespans that are not far above the maximal observed human lifespan. To approximate the complexity requirements of the underlying physiological function, we then constrain network entropies. Using non-parametric stochastic optimization of network structure, we find that disassortative scale-free networks exhibit the best of both lifespan and health span. Parametric optimization of scale-free networks behaves similarly. We further find that higher maximum connectivity and lower minimum connectivity networks enhance both maximal lifespans and health spans by allowing for more disassortative networks. Our results validate the scale-free network assumption of the GNM and indicate the importance of disassortativity in preserving health and longevity in the face of damage propagation during aging. Our results highlight the advantages provided by disassortative scale-free networks in biological organisms and subsystems.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,492
Score d'incertitude au seuil0,537

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,031
Tête enseignante GPT0,345
Écart entre enseignants0,314 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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