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Enregistrement W4321003410 · doi:10.1111/acel.13762

Endosomal trafficking protein <scp>TBC</scp>‐2 modulates stress resistance and lifespan through <scp>DAF</scp>‐16‐dependent and independent mechanisms

2023· article· en· W4321003410 sur OpenAlexafffund
Annika Traa, Sonja K. Soo, Abdelrahman AlOkda, Bokang Ko, Christian E. Rocheleau, Jeremy M. Van Raamsdonk

Notice bibliographique

RevueAging Cell · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetics, Aging, and Longevity in Model Organisms
Établissements canadiensMcGill UniversityMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesFonds de Recherche du Québec - SantéNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of Health
Mots-clésBiologyDownregulation and upregulationCell biologyMutantRabTranscription factorOsmotic shockEndosomeOxidative stressGeneBiochemistryGTPase

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The FOXO transcription factor, DAF-16, plays an integral role in insulin/IGF-1 signaling (IIS) and stress response. In conditions of stress or decreased IIS, DAF-16 moves to the nucleus where it activates genes that promote survival. To gain insight into the role of endosomal trafficking in resistance to stress, we disrupted tbc-2, which encodes a GTPase activating protein that inhibits RAB-5 and RAB-7. We found that tbc-2 mutants have decreased nuclear localization of DAF-16 in response to heat stress, anoxia, and bacterial pathogen stress, but increased nuclear localization of DAF-16 in response to chronic oxidative stress and osmotic stress. tbc-2 mutants also exhibit decreased upregulation of DAF-16 target genes in response to stress. To determine whether the rate of nuclear localization of DAF-16 affected stress resistance in these animals, we examined survival after exposure to multiple exogenous stressors. Disruption of tbc-2 decreased resistance to heat stress, anoxia, and bacterial pathogen stress in both wild-type worms and stress-resistant daf-2 insulin/IGF-1 receptor mutants. Similarly, deletion of tbc-2 decreases lifespan in both wild-type worms and daf-2 mutants. When DAF-16 is absent, the loss of tbc-2 is still able to decrease lifespan but has little or no impact on resistance to most stresses. Combined, this suggests that disruption of tbc-2 affects lifespan through both DAF-16-dependent and DAF-16-independent pathways, while the effect of tbc-2 deletion on resistance to stress is primarily DAF-16-dependent. Overall, this work demonstrates the importance of endosomal trafficking for the proper nuclear localization of DAF-16 during stress and that perturbation of normal endosomal trafficking is sufficient to decrease both stress resistance and lifespan.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,214
Écart entre enseignants0,205 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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