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Enregistrement W4322207820 · doi:10.1101/2023.02.23.23286373

Latin American Trans-ancestry INitiative for OCD genomics (LATINO): Study Protocol

2023· preprint· en· W4322207820 sur OpenAlexafffundabout
Carolina Cappi, Marcos E Ochoa-Panaifo, Renee M Frederick, Minjee Kook, Andrew D. Wiese, Diana Rancourt, Elizabeth G. Atkinson, Paola Giusti‐Rodríguez, Jacey L Anderberg, Jonathan S. Abramowitz, Victor R. Adorno, Cinthia Aguirre, Gustavo S. Alves, Gilberto Sousa Alves, NaEshia Ancalade, Alejandro A. Arellano Espinosa, Paul Arnold, Daphne M. Ayton, Izabela Guimarães Barbosa, Laura Marcela Barón Castaño, Cynthia N. Barrera, María Belén Prieto, María Celeste Berardo, Dayan Berrones, John R. Best, Tim B. Bigdeli, Christie L. Burton, Jennifer L. Callahan, Maria Cecília B. Carneiro, Sandra L. Cepeda, Evelyn Chazelle, Jessica M. Chire, Macarena Churruca Muñoz, Pamela Claisse Quiroz, Journa Cobite, Jonathan S. Comer, Daniel L. Costa, Jennifer Crosbie, Victor O. Cruz, Guillermo Dager, Luisa F. Daza, Anabel De la Rosa-Gómez, Daniela del Río, Fernanda Zetola Delage, Carolina Blaya Dreher, Lucila Fay, Tomas Fazio, Ygor Arzeno Ferrão, Gabriela M. Ferreira, Edith G. Figueroa, Leonardo F. Fontenelle, Diego A. Forero, Daniele T. H. Fragoso, Bharathi S. Gadad, Sheldon R. Garrison, Andres González, Laura D Gonzalez, Marco A. González, Polaris Gonzalez‐Barrios, Wayne K. Goodman, Jerry Guintivano, Daniel Guttfreund, Andrew G. Guzick, Matthew Halvorsen, Joseph D. Hovey, Reinhard Janssen‐Aguilar, Matias Jensen, Alexandra Z. Jimenez Reynolds, Joali Alexandra Juárez Lujambio, Nasim Khalfe, Madison A. Knutsen, Caleb W. Lack, Nuria Lanzagorta, Monicke O. Lima, Melanie O Longhurst, David Martínez, Elba S. Luna, Andrea Horvath Marques, Molly Martinez, Maria de Los Angeles Matos, Caitlyn E. Maye, Joseph McGuire, Gabriela B. de Menezes, Charlene Minaya, Tomás Miño, Sara Mithani, Circe Montes de, Alonso Morales‐Rivero, Maria E. Moreira‐de‐Oliveira, Olivia J. Morris, Sandra Ivonne Muñoz Maldonado, Zainab Naqqash, Ambar A. Núñez Bracho, Belinda E. Núñez Bracho, María Corina Ochoa Rojas, Luis A. Olavarria Castaman, Iliana Ortega, Darpan I. Patel, Ainsley K. Patrick, Mariel Paz y Miño, Jose L. Perales Orellana, Bárbara Perdigão Stumpf, Tamara Peregrina, Tania Pérez Duarte, Kelly Piacsek, Maritza Dorila Placencia Medina, Lucas C. Quarantini, Yana Quarantini‐Alvim, Renato T. Ramos, Iaroslava C. Ramos, Vanessa R. Ramos, Kesley A. Ramsey, Elise V. Ray, Margaret A. Richter, Bradley C. Riemann, Juan Carlos Rivas, Maria Conceição do Rosário, Camilo J. Ruggero, Ángel Alberto Ruíz-Chow, Alejandra Ruiz‐Velasco, Aline S. Sampaio, Leonardo Cardoso Saraiva, Russell Schachar, Sophie C. Schneider, Ethan J Schweissing, Laura D. Seligman, Roseli Gedanke Shavitt, Keaton J. Soileau, S. Evelyn Stewart, Shaina B. Storch, Emily Strouphauer, Kiara R. Timpano, Beatriz Treviño‐de la Garza, Javier Vargas‐Medrano, María I. Vásquez, Guadalupe Vidal Martínez, Saira A. Weinzimmer, Mauricio A. Yanez, Gwyneth Zai, Lina M. Zapata‐Restrepo, Luz M. Zappa, Raquel Marina Zepeda-Burgos, Anthony W. Zoghbi, Eurı́pedes Constantino Miguel, Carolyn I. Rodríguez, Mayra C Martinez Mallen, Pablo R. Moya, Tania Borda, María Beatriz Moyano, Manuel Mattheisen, Stacey Pereira, Gabriel Lázaro‐Muñoz, Karen G. Martinez‐Gonzalez, Michele T. Pato, Humberto Nicolini, Eric A. Storch

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2023
Typepreprint
Langueen
DomainePsychology
ThématiqueObsessive-Compulsive Spectrum Disorders
Établissements canadiensCentre for Addiction and Mental HealthBC Mental Health & Substance Use ServicesHealth Sciences CentreSunnybrook Health Science CentreDalhousie UniversityBC Children's HospitalUniversity of TorontoHospital for Sick ChildrenUniversity of British ColumbiaUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesNational Institute of Mental HealthAlberta InnovatesFundação Carlos Chagas Filho de Amparo à Pesquisa do Estado do Rio de JaneiroConselho Nacional de Desenvolvimento Científico e TecnológicoUniversity of TorontoSubstance Abuse and Mental Health Services AdministrationCoordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível SuperiorDepartment of Psychiatry, University of TorontoInstituto D'Or de Pesquisa e EnsinoPatient-Centered Outcomes Research InstituteNational Institutes of HealthNational Science Foundation
Mots-clésLatin AmericansGenetic genealogyGenomicsGenome-wide association studyPolygenic risk scoreIdentification (biology)MedicineGeneticsBiologySingle-nucleotide polymorphismGenomePopulationPolitical scienceGenotypeEnvironmental healthGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Obsessive-compulsive disorder (OCD) is a debilitating psychiatric disorder. Worldwide, its prevalence is ~2% and its etiology is mostly unknown. Identifying biological factors contributing to OCD will elucidate underlying mechanisms and might contribute to improved treatment outcomes. Genomic studies of OCD are beginning to reveal long-sought risk loci, but >95% of the cases currently in analysis are of homogenous European ancestry. If not addressed, this Eurocentric bias will result in OCD genomic findings being more accurate for individuals of European ancestry than other ancestries, thereby contributing to health disparities in potential future applications of genomics. In this study protocol paper, we describe the Latin American Trans-ancestry INitiative for OCD genomics (LATINO, www.latinostudy.org). LATINO is a new network of investigators from across Latin America, the United States, and Canada who have begun to collect DNA and clinical data from 5,000 richly-phenotyped OCD cases of Latin American ancestry in a culturally sensitive and ethical manner. In this project, we will utilize trans-ancestry genomic analyses to accelerate the identification of OCD risk loci, fine-map putative causal variants, and improve the performance of polygenic risk scores in diverse populations. We will also capitalize on rich clinical data to examine the genetics of treatment response, biologically plausible OCD subtypes, and symptom dimensions. Additionally, LATINO will help elucidate the diversity of the clinical presentations of OCD across cultures through various trainings developed and offered in collaboration with Latin American investigators. We believe this study will advance the important goal of global mental health discovery and equity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,229
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,102
Tête enseignante GPT0,408
Écart entre enseignants0,306 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2023
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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