Lack of reproducibility of histopathological features in <i>MYC</i>‐rearranged large B cell lymphoma using digital whole slide images: a study from the Lunenburg lymphoma biomarker consortium
Notice bibliographique
Résumé
AIMS: Subclassification of large B cell lymphoma (LBCL) is challenging due to the overlap in histopathological, immunophenotypical and genetic data. In particular, the criteria to separate diffuse large B cell lymphoma (DLBCL) and high-grade B cell lymphoma (HGBL) are difficult to apply in practice. The Lunenburg Lymphoma Biomarker Consortium previously reported a cohort of over 5000 LBCL that included fluorescence in-situ hybridisation (FISH) data. This cohort contained 209 cases with MYC rearrangement that were available for a validation study by a panel of eight expert haematopathologists of how various histopathological features are used. METHODS AND RESULTS: Digital whole slide images of haematoxylin and eosin-stained sections allowed the pathologists to visually score cases independently as well as participate in virtual joint review conferences. Standardised consensus guidelines were formulated for scoring histopathological features and included overall architecture/growth pattern, presence or absence of a starry-sky pattern, cell size, nuclear pleomorphism, nucleolar prominence and a range of cytological characteristics. Despite the use of consensus guidelines, the results show a high degree of discordance among the eight expert pathologists. Approximately 50% of the cases lacked a majority score, and this discordance spanned all six histopathological features. Moreover, none of the histological variables aided in prediction of MYC single versus double/triple-hit or immunoglobulin-partner FISH-based designations or clinical outcome measures. CONCLUSIONS: Our findings indicate that there are no specific conventional morphological parameters that help to subclassify MYC-rearranged LBCL or select cases for FISH analysis, and that incorporation of FISH data is essential for accurate classification and prognostication.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,040 | 0,072 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,003 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,002 |
| Communication savante | 0,003 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,002 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».