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Enregistrement W4323364651 · doi:10.1101/2023.03.02.530837

3D Co-culture Model on the Role of Vimentin in Notch Signaling and Vascularization

2023· preprint· en· W4323364651 sur OpenAlexaff
Khalil Dayekh, Kibret Mequanint

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2023
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCell Adhesion Molecules Research
Établissements canadiensWestern University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésVimentinNotch signaling pathwayCell biologySignal transductionNeovascularizationAngiogenesisBiologyCancer researchImmunologyImmunohistochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The Notch signaling pathway is a conserved pathway that is central in vascular tissue development and pathology. Because this pathway controls such important events, it is regulated at multiple steps of its cascade, such as post-translational modification of its ligand and receptor. Recent studies have suggested regulation of the Notch signaling by a pulling force to be required to activate Notch signaling. In this exploratory study, 3D fibrin gels were used as a co-culture system of endothelial cells and 10T1/2 cells to assess whether vimentin is implicated in the regulation of Notch signaling and neovascularization. The results show that 10T1/2 cells increase the expression of Hes-1, Hes-5, and Acta2 during co-culture with human coronary artery endothelial cells (HCAECs) and that vimentin knock-down using siRNA partially reduced the expression under static conditions. On the other hand, while the same trend was observed for Hes-5 under dynamic conditions, Acta2 was overexpressed, and vimentin knock-down did not affect its expression levels. Moreover, the development of newly formed micro-vessels is observed in 3D fibrin gels in the presence of VEGF but could not be formed when vimentin expression was knocked down. These results suggest that vimentin plays a secondary role in Notch signaling; however, it is essential for neovascularization.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,262
Écart entre enseignants0,239 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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