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Enregistrement W4323904076 · doi:10.5376/mpb.2023.14.0005

Cloning and Expression Analysis of MaMYB308 Gene in Mulberry

2023· article· en· W4323904076 sur OpenAlexvenueno aff
Yanmei Wei, Xinru Zhao, Yujia Li, Yuning Wang, LI Jie-qiu, Jiaorong Meng

Notice bibliographique

RevueMolecular Plant Breeding · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueSilkworms and Sericulture Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNatural Science Foundation of Guangxi ProvinceNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésMYBBiologyComplementary DNAOpen reading frameTranscription factorGeneAbiotic stressGene expressionGeneticsCloning (programming)Molecular biologyPeptide sequence

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In order to analyze the function of MYB transcription factors in mulberry abiotic stress and development, the full-length cDNA sequence of MYB transcription factor MaMYB308 was cloned from the mulberry cultivar ‘Guiyou 62’. The amino acid sequence of MYB transcription factor MaMYB308 was analyzed by bioinformatics, and its self activation was verified by yeast single hybridization. The expression pattern of the gene under different tissue and abiotic stresses was detected by real-time fluorescence quantitative PCR. The results showed that the full length of MaMYB308 gene is 1 266 bp, including an open reading frame of 1 026 bp, which can encode 341 amino acids, and its molecular weight is 39 kD; it has two SANT domains, belonging to typical R2R3 type MYB transcription factor, and has self activating activity. Blast results showed that MaMYB308 had high homology with a variety of R2R3-MYB transcription factors from higher plants, and had the highest homology with MYB308 from Morus notabilis , and the consistency of amino acid level was 96.48%. The results of real-time fluorescence quantitative PCR showed that the expression of MaMYB308 in roots, stems and leaves of mulberry was significantly higher than that in stems and leaves, and it was responsive to abiotic stresses such as high temperature, low temperature, high salt and drought. Among them, the expression of MaMYB308 was the most significant under low temperature stress, about 40 times of the control. The results of this study could be helpful for further study on the biological function of mulberry MaMYB308 gene and the stress resistance mechanism of mulberry.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,240
Écart entre enseignants0,211 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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