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Enregistrement W4324013476 · doi:10.1139/y00-079

Couplage électronique et transferts de charges dans l'ADN : étude du contrôle énergétique

2001· article· en· W4324013476 sur OpenAlexvenueno aff
Mustapha Benrahmoune, Abdelali Filali-Mouhim, Jean‐Paul Jay‐Gerin

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Physiology and Pharmacology · 2001
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDNA and Nucleic Acid Chemistry
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSuperexchangePhysicsDimensionless quantityAtomic orbitalAtomic physicsHamiltonian (control theory)ElectronCoupling (piping)Quantum mechanicsIonMaterials science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The influence of the energetic gap on the effective distance-decay rate of electronic coupling (βeff) in DNA is investigated in the context of the superexchange mechanism. The DNA double helix is described by a tight-binding electronic Hamiltonian model, in which all orbitals have the same energy and interact with one another through an exponentially decaying function of distance. Our numerical results concerning the βeff values obtained for two different DNA molecules are analyzed within the theoretical framework of the "continuous-medium approximation," previously developed by Lopez-Castillo et al. (J.-M. Lopez-Castillo, A. Filali-Mouhim, I.L. Plante, and J.-P. Jay-Gerin. J. Phys. Chem. 99 : 6864-6875, 1995). We find that the intervening DNA bridge between the donor and acceptor sites is defined by a unique dimensionless control parameter Γ/E, where E is the energy of the orbitals of this medium with respect to those of the redox site orbitals (energetic gap) and Γ is the electronic band width of the bridge considered as a continuous medium. In the narrow-band regime, our "through-space" coupling model predicts βeff values that are in good order of magnitude agreement with those calculated by other theoretical approaches as well as with those obtained from experiment. Moreover, under equivalent energetic conditions, the DNA-mediated transfers of holes and electrons differ considerably. This difference depends upon the sign of the parameter Γ/E.Key words: DNA, electronic coupling, effective distance-decay rate, energetic gap, superexchange mechanism, continuous-medium approximation, long-distance electron and hole transfers.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,005
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,005
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,002
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,233
Écart entre enseignants0,229 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2001
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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