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Enregistrement W4324140055 · doi:10.1161/circ.147.suppl_1.p619

Abstract P619: DNA Methylation at <i>SREBF1</i> and Long-Term Changes in Body Composition: The POUNDS Lost Trial

2023· article· en· W4324140055 sur OpenAlexaff
Xiang Li, Xiaojian Shao, Qiaochu Xue, Minghao Kou, Elin Grundberg, George A. Bray, Frank M. Sacks, Lu Qi

Notice bibliographique

RevueCirculation · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEpigenetics and DNA Methylation
Établissements canadiensNational Research Council Canada
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicinedNaMObesityOverweightEndocrinologyInternal medicineWeight lossBody mass indexFat massAnimal scienceDNA methylationBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Introduction: A previous epigenome-wide association study has causally linked DNA methylation (DNAm) at the SREBF1 gene (cg11024682) with obesity and lipids. However, little is known about whether DNAm at SREBF1 is associated with long-term changes in body adiposity and composition. Hypothesis: We hypothesized that participants with different DNAm at SRBF1 might respond differently to dietary weight-loss interventions on changes in body adiposity and composition. Methods: The current study included 314 individuals with overweight or obese, who participated in POUNDS Lost: a 2-year randomized dietary weight-loss trial. The blood DNAm level was profiled by methylC-capture sequencing at baseline. Regional DNAm at SREBF1 was calculated as the average methylation level over CpGs within ±250 bp of cg11024682. Body composition, including total fat mass (FM), percentage of FM (FM%), total fat-free mass (FFM), percentage of FFM (FFM%), and percentage of trunk fat (TF%) were measured by dual-energy X-ray absorptiometry (DEXA) at baseline, 6 months, and 2 years. Results: Lower regional DNAm at SREBF1 was significantly associated with changes in body composition across 2 years ( Table ). At 6 months, per SD lower regional DNAm at SREBF1 was significantly associated with greater reductions in FM (β [SE] -0.23 [0.07], p=0.002), FM% (-0.30 [0.09], p<0.001), and TF% (-0.44 [0.13], p<0.001), and greater increases in FFM (0.18 [0.08], p=0.028) and FFM% (0.30 [0.09], p<0.001), regardless of dietary intervention groups and independent of concurrent weight loss. Such association remained at 2 years: FM (β [SE] -0.21 [0.10], p=0.045), FM% (-0.32 [0.11], p=0.004), TF% (-0.36 [0.16], p=0.026), FFM (0.22 [0.12], p=0.07) and FFM% (0.32 [0.11], p=0.004). Conclusions: Overweight and obese individuals with a lower regional DNAm at SREBF1 achieved greater improvement in body composition across the 2-year intervention, independent of concurrent weight loss, suggesting DNAm at SREBF1 is predictive of individuals’ response to treatment.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Essai randomisé · Signal consensuel: Essai randomisé
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,015

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,287
Écart entre enseignants0,262 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeEssai randomisé
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
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