Autophagy-enhancing ATG16L1 polymorphism improves clinical outcomes and promotes superior T-cell immunity in chronic HIV-1 infection
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Chronic HIV-1 infection is characterized by T-cell dysregulation that is only partly restored by antiretroviral therapy. Here, we demonstrate a protective role for autophagy in HIV-1 disease pathogenesis. Targeted analysis of genetic variation in core autophagy gene ATG16L1 revealed a previously unidentified polymorphism, which correlated functionally with enhanced autophagy and clinically with improved survival of untreated HIV-1-infected individuals. Intrinsically-enhanced autophagy in homozygous minor T-cells resulted in superior antiviral immunity, evidenced by increased proliferation, revamped immune responsiveness, and suppressed exhaustion/immunosenescence features. In-depth flow-cytometric and transcriptional T-helper-profiling revealed signatures unique to minor genotyped individuals with enriched regulation of pro-inflammatory networks and skewing towards immunoregulatory T-cell-phenotype. Treatment with autophagy-enhancing pharmaceuticals reprogrammed T-cells to exhibit the protective traits observed in homozygous minor donors. These data underscore the in vivo relevance of autophagy for longer-lasting T-cell-mediated HIV-1 control, with implications towards development of host-directed therapeutics targeting autophagy to restore immune function in chronic HIV-1 infection.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».