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Enregistrement W4327740286 · doi:10.26434/chemrxiv-2023-lqhrx

Phosphonated glycans as post-translational modifications of proteins in velvet worm slime

2023· preprint· en· W4327740286 sur OpenAlexaff
Alexander Poulhazan, Alexander B. Baer, Gagan Daliaho, Frédéric Mentink‐Vigier, Alexandre A. Arnold, Darren C. Browne, Lars Hering, Stephanie Archer‐Hartmann, Lauren E. Pepi, Parastoo Azadi, Stephan Schmidt, Georg Mayer, Isabelle Marcotte, Matthew J. Harrington

Notice bibliographique

RevueChemRxiv · 2023
Typepreprint
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueTardigrade Biology and Ecology
Établissements canadiensMcGill UniversityUniversité du Québec à Montréal
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSlime moldPhosphonateVelvetBiologySILKChemistryBiochemistryOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

To capture prey, onychophorans (velvet worms) expel a slime that forms stiff fibers upon shearing and dehydration. The high quantities of phosphorus previously found in the slime of the velvet worm Euperipatoides rowelli were ascribed to protein phosphorylation. We provide clear evidence, instead, that it is primarily present as phosphonate moieties in the slime of representative from both major onychophoran subgroups which diverged ~380 MYA. Advanced NMR and mass spectrometry demonstrate that 2-aminoethyl phosphonate (2-AEP) is associated with high molecular weight slime proteins as phosphonoglycans. Biogenic phosphonates are a substantial component of the organophosphorus cycle in marine environments but were not previously reported in terrestrial invertebrates. The evolutionary conservation of this rare protein modification suggests a potential role in the formation and function of these biological adhesive fibers with implications for bio-inspiration.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,782
Score d'incertitude au seuil0,646

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,042
Tête enseignante GPT0,248
Écart entre enseignants0,205 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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