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Enregistrement W4327843980 · doi:10.1101/2023.03.17.533092

Antibodies generated <i>in vitro</i> and <i>in vivo</i> elucidate design of a thermostable ADDomer COVID-19 nasal nanoparticle vaccine

2023· preprint· en· W4327843980 sur OpenAlexfundno aff
Dora Buzas, H. Adrian Bunzel, Oskar Staufer, Emily Milodowski, Joshua C. Bufton, Beatriz Vidaña, Sathish K.N. Yadav, Kapil Gupta, Charlotte Fletcher, Maia Kavanagh Williamson, Alexandra Harrison, Ufuk Borucu, Julien Capin, Ore Francis, Georgia Balchin, Sophie Hall, Mirella Vivoli, Fabien Durbesson, Renaud Vincentelli, Joe Roe, Linda Wooldridge, Rachel Burt, J. L. Ross Anderson, Adrian J. Mulholland, Jonathan Hare, Mick Bailey, Andrew D. Davidson, Adam Finn, David Morgan, Jamie F. S. Mann, Joachim P. Spatz, Frédéric Garzoni, Christiane Schaffitzel, Imre Berger

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2023
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSARS-CoV-2 and COVID-19 Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesBrisSynBioBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilMedical Research CouncilBundesministerium für Bildung und ForschungWeizmann Institute of ScienceMax-Planck-GesellschaftU.S. Food and Drug AdministrationEngineering and Physical Sciences Research CouncilHeidelberg Biosciences International Graduate SchoolUK Research and InnovationDeutsche ForschungsgemeinschaftUniversity of BristolHamilton Health Sciences FoundationBritish Society for Antimicrobial ChemotherapyWellcome Trust
Mots-clésEpitopeVirologyIn vitroCoronavirus disease 2019 (COVID-19)AntibodyIn vivoSevere acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2)ChemistryComputational biologyBiologyInfectious disease (medical specialty)ImmunologyMedicineBiochemistryGeneticsDisease

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract COVID-19 continues to damage populations, communities and economies worldwide. Vaccines have reduced COVID-19-related hospitalisations and deaths, primarily in developed countries. Persisting infection rates, and highly transmissible SARS-CoV-2 Variants of Concern (VOCs) causing repeat and breakthrough infections, underscore the ongoing need for new treatments to achieve a global solution. Based on ADDomer, a self-assembling protein nanoparticle scaffold, we created ADDoCoV, a thermostable COVID-19 candidate vaccine displaying multiple copies of a SARS-CoV-2 receptor binding motif (RBM)-derived epitope. In vitro generated neutralising nanobodies combined with molecular dynamics (MD) simulations and electron cryo-microscopy (cryo-EM) established authenticity and accessibility of the epitopes displayed. A Gigabody comprising multimerized nanobodies prevented SARS-CoV-2 virion attachment with picomolar EC 50 . Antibodies generated by immunising mice cross-reacted with VOCs including Delta and Omicron. Our study elucidates nasal administration of ADDomer-based nanoparticles for active and passive immunisation against SARS-CoV-2 and provides a blueprint for designing nanoparticle reagents to combat respiratory viral infections.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,045
Tête enseignante GPT0,298
Écart entre enseignants0,253 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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