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Enregistrement W4327861548 · doi:10.1101/2023.03.17.532588

Phenotypic and spatial heterogeneity of brain myeloid cells after stroke is associated with cell ontogeny, tissue damage, and brain connectivity

2023· preprint· en· W4327861548 sur OpenAlexaff
Anirudh Patir, Jack Barrington, Stefan Szymkowiak, Dana Straus, Alessio Alfieri, Lucas Lefèvre, Neil C. Henderson, Karen Horsburgh, Prakash Ramachandran, Barry W. McColl

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2023
Typepreprint
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueNeuroinflammation and Neurodegeneration Mechanisms
Établissements canadiensDiscovery Centre
Organismes subventionnairesUK Dementia Research InstituteFondation LeducqMedical Research CouncilAlzheimer's SocietyWellcome Trust
Mots-clésPhenotypeMyeloidBiologyOntogenyNeuroscienceCell typeCellMicrogliaImmune systemStroke (engine)ImmunologyInflammationGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Summary Acute stroke causes substantial mortality and morbidity and provokes extensive changes to myeloid immune cell populations in the brain that may be targets for limiting brain damage and enhancing brain repair. The most effective immunomodulatory approaches will require precise manipulation of discrete myeloid cell phenotypes in time and space to avoid harmful effects of indiscriminate neuroimmune perturbation. We sought to define how stroke alters the composition and phenotypes of mononuclear myeloid cells with particular attention to how cell ontogeny and spatial organisation combine to expand myeloid cell diversity across the brain after stroke. Multiple reactive microglial states and dual monocyte-derived populations contributed to an extensive repertoire of myeloid cells in post-stroke brain. We identified important overlap and distinctions among different cell types and states that involved ontogeny- and spatial-related properties. Notably, brain connectivity with infarcted tissue underpinned the pattern of local and remote altered cell accumulation and reactivity. Our discoveries suggest a global but anatomically-governed brain myeloid cell response to stroke that comprises diverse phenotypes arising through intrinsic cell ontogeny factors interacting with exposure to spatially-organised brain damage and neuroaxonal cues.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,227
Écart entre enseignants0,207 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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