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Enregistrement W4327893774 · doi:10.1094/pdis-10-22-2492-pdn

First Report of <i>Puccinia lagenophorae</i> on <i>Senecio vulgaris</i> in Pennsylvania

2023· article· en· W4327893774 sur OpenAlexaboutno aff
R. Harvey, Donald D. Davis, D. Rabern Simmons, M. Catherine Aime

Notice bibliographique

RevuePlant Disease · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueYeasts and Rust Fungi Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyWeedOrange (colour)SenecioPucciniaBotanyRust (programming language)Host (biology)Ornamental plantHorticultureEcology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Common groundsel (Senecio vulgaris L.), is an aster native to Eurasia and is now a common weed in gardens, roadsides and vacant lots worldwide. In 2001, Scholler and Toike were first to report that common groundsel was a host for the rust fungus Puccinia lagenophorae Cooke in North America (Scholler and Toike 2001). This report from California was followed by reports of P. lagenophorae infections on common groundsel in New York, Oklahoma, and Oregon (Little-field et al. 2005). In 2007, Bruckart et al. published the first report of this host-pathogen combi-nation in Canada (Bruckart et al. 2007). To our knowledge, there are no published reports of P. lagenophorae on common groundsel in Pennsylvania (Farr and Rossman 2022). In May 2022, symptomatic common groundsel plants were observed in Biglerville, Adams Co., southern Penn-sylvania (N 39.9268047, E 77.2473878). Host plants exhibited conspicuous aecia on deformed stems (Fig. 1). Disease symptomology and morphology were consistent with P. langenophorae (Scholler and Toike 2001). P. lagenophorae is an autoecious rust that forms aecia and telia, but only aecia are typically formed on Senecio spp.; telia were not noted during our observations. Aecia were orange, cup-shaped, bordered by fragmented recurved peridia (Fig. 1), and they had mean diameters 262.9 ± 20.9 X 175.2 ± 22.2 μm (n = 20). Aeciospores were orange, oval, with mean diameters of 16.5 ± 0.97 X 11.5 ± 1.08 μm (n = 20). Fungal DNA was extracted from symptomatic stems. Polymerase chain reaction and sequencing of the 28S region of the nuclear ribosomal DNA repeat were conducted with primers Rust2inv and LR6 following protocols in Aime (2006). The sequence shared 100% identity (909 / 909 bp) with 8 sequences of P. la-genphorae in GenBank, including one on Ozothamnus cordatus from Perth, Western Australia, Australia (KF690699), vouchered in the Queensland Plant Pathology Herbarium (BRIP 57770), Brisbane, Queensland, Australia. A voucher specimen has been preserved in the Arthur Fungari-um at Purdue University (PUR N24039) with corresponding 28S sequence (GenBank accession OP718536).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,149
Score d'incertitude au seuil0,481

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,234
Écart entre enseignants0,223 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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